Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.12□□□□□ -2.59
YHP1Q04116 YFL019CYFL019C 354 nt-1.12□□□□□ -2.59
YHP1Q04116 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.12□□□□□ -2.59
YHP1Q04116 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-1.12□□□□□ -2.59
YHP1Q04116 snR39BsnR39B 96 nt-1.12□□□□□ -2.59
YHP1Q04116 YDR413CYDR413C 576 nt-1.13□□□□□ -2.59
YHP1Q04116 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-1.14□□□□□ -2.59
YHP1Q04116 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-1.14□□□□□ -2.59
YHP1Q04116 RPL39YJL189W 156 nt-1.14□□□□□ -2.59
YHP1Q04116 JLP2YMR132C 627 nt-1.14□□□□□ -2.59
YHP1Q04116 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-1.17□□□□□ -2.6
YHP1Q04116 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-1.17□□□□□ -2.6
YHP1Q04116 YER181CYER181C 324 nt-1.19□□□□□ -2.6
YHP1Q04116 VAR1Q0140 1197 nt-1.2□□□□□ -2.6
YHP1Q04116 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-1.2□□□□□ -2.6
YHP1Q04116 YKL118WYKL118W 312 nt-1.21□□□□□ -2.6
YHP1Q04116 snR67snR67 82 nt-1.22□□□□□ -2.6
YHP1Q04116 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-1.22□□□□□ -2.6
YHP1Q04116 snR55snR55 98 nt-1.25□□□□□ -2.61
YHP1Q04116 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.25□□□□□ -2.61
YHP1Q04116 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.28□□□□□ -2.61
YHP1Q04116 SKI7YOR076C 2244 nt-1.3□□□□□ -2.62
YHP1Q04116 GIM4YEL003W 336 nt-1.3□□□□□ -2.62
YHP1Q04116 YBR178WYBR178W 375 nt-1.3□□□□□ -2.62
YHP1Q04116 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-1.32□□□□□ -2.62
YHP1Q04116 YPR012WYPR012W 255 nt-1.32□□□□□ -2.62
YHP1Q04116 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.34□□□□□ -2.62
YHP1Q04116 YNL205CYNL205C 423 nt-1.38□□□□□ -2.63
YHP1Q04116 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-1.4□□□□□ -2.63
YHP1Q04116 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.42□□□□□ -2.64
YHP1Q04116 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.44□□□□□ -2.64
YHP1Q04116 YOR302WYOR302W 78 nt-1.44□□□□□ -2.64
YHP1Q04116 snR48snR48 113 nt-1.45□□□□□ -2.64
YHP1Q04116 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-1.48□□□□□ -2.65
YHP1Q04116 YOR102WYOR102W 351 nt-1.48□□□□□ -2.65
YHP1Q04116 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.49□□□□□ -2.65
YHP1Q04116 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.49□□□□□ -2.65
YHP1Q04116 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-1.51□□□□□ -2.65
YHP1Q04116 snR52snR52 92 nt-1.51□□□□□ -2.65
YHP1Q04116 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.52□□□□□ -2.65
YHP1Q04116 snR65snR65 100 nt-1.53□□□□□ -2.65
YHP1Q04116 snR77snR77 88 nt-1.56□□□□□ -2.66
YHP1Q04116 Q0144Q0144 330 nt-1.56□□□□□ -2.66
YHP1Q04116 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.56□□□□□ -2.66
YHP1Q04116 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-1.56□□□□□ -2.66
YHP1Q04116 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.57□□□□□ -2.66
YHP1Q04116 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.59□□□□□ -2.66
YHP1Q04116 snR81snR81 201 nt-1.63□□□□□ -2.67
YHP1Q04116 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.65□□□□□ -2.67
YHP1Q04116 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-1.69□□□□□ -2.68
YHP1Q04116 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.72□□□□□ -2.68
YHP1Q04116 snR80snR80 171 nt-1.74□□□□□ -2.69
YHP1Q04116 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.76□□□□□ -2.69
YHP1Q04116 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-1.8□□□□□ -2.7
YHP1Q04116 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-1.81□□□□□ -2.7
YHP1Q04116 snR56snR56 88 nt-1.84□□□□□ -2.7
YHP1Q04116 YNL198CYNL198C 303 nt-1.84□□□□□ -2.7
YHP1Q04116 YJL150WYJL150W 303 nt-1.85□□□□□ -2.71
YHP1Q04116 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.89□□□□□ -2.71
YHP1Q04116 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.89□□□□□ -2.71
YHP1Q04116 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.9□□□□□ -2.71
YHP1Q04116 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.91□□□□□ -2.72
YHP1Q04116 YOR309CYOR309C 381 nt-1.91□□□□□ -2.72
YHP1Q04116 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.92□□□□□ -2.72
YHP1Q04116 YBL053WYBL053W 375 nt-1.94□□□□□ -2.72
YHP1Q04116 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-2.02□□□□□ -2.73
YHP1Q04116 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-2.03□□□□□ -2.73
YHP1Q04116 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-2.06□□□□□ -2.74
YHP1Q04116 RPL41AYDL184C 78 nt-2.07□□□□□ -2.74
YHP1Q04116 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-2.07□□□□□ -2.74
YHP1Q04116 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-2.16□□□□□ -2.76
YHP1Q04116 YGR151CYGR151C 336 nt-2.18□□□□□ -2.76
YHP1Q04116 snR38snR38 95 nt-2.2□□□□□ -2.76
YHP1Q04116 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-2.22□□□□□ -2.76
YHP1Q04116 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-2.28□□□□□ -2.77
YHP1Q04116 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-2.31□□□□□ -2.78
YHP1Q04116 snR6snR6 112 nt-2.34□□□□□ -2.78
YHP1Q04116 YDR543CYDR543C 300 nt-2.34□□□□□ -2.78
YHP1Q04116 snR47snR47 99 nt-2.34□□□□□ -2.78
YHP1Q04116 SPG3YDR504C 384 nt-2.39□□□□□ -2.79
YHP1Q04116 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-2.39□□□□□ -2.79
YHP1Q04116 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-2.39□□□□□ -2.79
YHP1Q04116 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.42□□□□□ -2.8
YHP1Q04116 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.43□□□□□ -2.8
YHP1Q04116 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.45□□□□□ -2.8
YHP1Q04116 snR73snR73 106 nt-2.46□□□□□ -2.8
YHP1Q04116 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.5□□□□□ -2.81
YHP1Q04116 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-2.58□□□□□ -2.82
YHP1Q04116 YKL225WYKL225W 348 nt-2.6□□□□□ -2.83
YHP1Q04116 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-2.61□□□□□ -2.83
YHP1Q04116 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.61□□□□□ -2.83
YHP1Q04116 Q0142Q0142 177 nt-2.62□□□□□ -2.83
YHP1Q04116 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.64□□□□□ -2.83
YHP1Q04116 YNL337WYNL337W 255 nt-2.64□□□□□ -2.83
YHP1Q04116 YNL338WYNL338W 159 nt-2.65□□□□□ -2.83
YHP1Q04116 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.68□□□□□ -2.84
YHP1Q04116 snR85snR85 171 nt-2.74□□□□□ -2.85
YHP1Q04116 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.74□□□□□ -2.85
YHP1Q04116 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.89□□□□□ -2.87
YHP1Q04116 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.91□□□□□ -2.88
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