Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 YPR012WYPR012W 255 nt-0.82□□□□□ -2.54
UPS3Q04006 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.83□□□□□ -2.54
UPS3Q04006 YFL019CYFL019C 354 nt-0.83□□□□□ -2.54
UPS3Q04006 YNL266WYNL266W 420 nt-0.84□□□□□ -2.54
UPS3Q04006 YER181CYER181C 324 nt-0.85□□□□□ -2.55
UPS3Q04006 snR49snR49 165 nt-0.85□□□□□ -2.55
UPS3Q04006 snR50snR50 90 nt-0.85□□□□□ -2.55
UPS3Q04006 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.86□□□□□ -2.55
UPS3Q04006 Q0144Q0144 330 nt-0.87□□□□□ -2.55
UPS3Q04006 RDS3YPR094W 324 nt-0.88□□□□□ -2.55
UPS3Q04006 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.89□□□□□ -2.55
UPS3Q04006 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.89□□□□□ -2.55
UPS3Q04006 GIM4YEL003W 336 nt-0.9□□□□□ -2.55
UPS3Q04006 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.9□□□□□ -2.55
UPS3Q04006 snR39BsnR39B 96 nt-0.91□□□□□ -2.56
UPS3Q04006 snR55snR55 98 nt-0.93□□□□□ -2.56
UPS3Q04006 JLP2YMR132C 627 nt-0.94□□□□□ -2.56
UPS3Q04006 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.94□□□□□ -2.56
UPS3Q04006 snR161snR161 161 nt-0.94□□□□□ -2.56
UPS3Q04006 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1□□□□□ -2.57
UPS3Q04006 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.01□□□□□ -2.57
UPS3Q04006 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.02□□□□□ -2.57
UPS3Q04006 YOR302WYOR302W 78 nt-1.02□□□□□ -2.57
UPS3Q04006 snR67snR67 82 nt-1.03□□□□□ -2.57
UPS3Q04006 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-1.04□□□□□ -2.58
UPS3Q04006 SKI7YOR076C 2244 nt-1.04□□□□□ -2.58
UPS3Q04006 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.05□□□□□ -2.58
UPS3Q04006 YBR178WYBR178W 375 nt-1.06□□□□□ -2.58
UPS3Q04006 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-1.07□□□□□ -2.58
UPS3Q04006 snR65snR65 100 nt-1.09□□□□□ -2.58
UPS3Q04006 snR48snR48 113 nt-1.09□□□□□ -2.58
UPS3Q04006 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.11□□□□□ -2.59
UPS3Q04006 YNL205CYNL205C 423 nt-1.11□□□□□ -2.59
UPS3Q04006 YNR077CYNR077C 255 nt-1.12□□□□□ -2.59
UPS3Q04006 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.14□□□□□ -2.59
UPS3Q04006 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-1.18□□□□□ -2.6
UPS3Q04006 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-1.19□□□□□ -2.6
UPS3Q04006 snR52snR52 92 nt-1.19□□□□□ -2.6
UPS3Q04006 YOR102WYOR102W 351 nt-1.22□□□□□ -2.6
UPS3Q04006 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.23□□□□□ -2.61
UPS3Q04006 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-1.24□□□□□ -2.61
UPS3Q04006 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-1.25□□□□□ -2.61
UPS3Q04006 snR80snR80 171 nt-1.27□□□□□ -2.61
UPS3Q04006 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.27□□□□□ -2.61
UPS3Q04006 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-1.28□□□□□ -2.61
UPS3Q04006 snR56snR56 88 nt-1.29□□□□□ -2.62
UPS3Q04006 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.3□□□□□ -2.62
UPS3Q04006 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.31□□□□□ -2.62
UPS3Q04006 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.33□□□□□ -2.62
UPS3Q04006 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.33□□□□□ -2.62
UPS3Q04006 snR77snR77 88 nt-1.34□□□□□ -2.62
UPS3Q04006 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.38□□□□□ -2.63
UPS3Q04006 YNL198CYNL198C 303 nt-1.43□□□□□ -2.64
UPS3Q04006 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.43□□□□□ -2.64
UPS3Q04006 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-1.45□□□□□ -2.64
UPS3Q04006 snR81snR81 201 nt-1.47□□□□□ -2.64
UPS3Q04006 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.48□□□□□ -2.65
UPS3Q04006 YBL053WYBL053W 375 nt-1.49□□□□□ -2.65
UPS3Q04006 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.5□□□□□ -2.65
UPS3Q04006 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.51□□□□□ -2.65
UPS3Q04006 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.54□□□□□ -2.66
UPS3Q04006 YJL150WYJL150W 303 nt-1.54□□□□□ -2.66
UPS3Q04006 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.62□□□□□ -2.67
UPS3Q04006 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.64□□□□□ -2.67
UPS3Q04006 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.64□□□□□ -2.67
UPS3Q04006 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.69□□□□□ -2.68
UPS3Q04006 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.74□□□□□ -2.69
UPS3Q04006 RPL41AYDL184C 78 nt-1.76□□□□□ -2.69
UPS3Q04006 YOR309CYOR309C 381 nt-1.77□□□□□ -2.69
UPS3Q04006 snR38snR38 95 nt-1.78□□□□□ -2.69
UPS3Q04006 YGR151CYGR151C 336 nt-1.79□□□□□ -2.7
UPS3Q04006 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.8□□□□□ -2.7
UPS3Q04006 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.81□□□□□ -2.7
UPS3Q04006 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.81□□□□□ -2.7
UPS3Q04006 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.86□□□□□ -2.71
UPS3Q04006 SPG3YDR504C 384 nt-1.87□□□□□ -2.71
UPS3Q04006 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.88□□□□□ -2.71
UPS3Q04006 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.93□□□□□ -2.72
UPS3Q04006 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.96□□□□□ -2.72
UPS3Q04006 snR47snR47 99 nt-1.96□□□□□ -2.72
UPS3Q04006 snR6snR6 112 nt-1.99□□□□□ -2.73
UPS3Q04006 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-2.04□□□□□ -2.74
UPS3Q04006 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-2.05□□□□□ -2.74
UPS3Q04006 Q0142Q0142 177 nt-2.05□□□□□ -2.74
UPS3Q04006 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.08□□□□□ -2.74
UPS3Q04006 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.12□□□□□ -2.75
UPS3Q04006 YNL338WYNL338W 159 nt-2.13□□□□□ -2.75
UPS3Q04006 snR73snR73 106 nt-2.17□□□□□ -2.76
UPS3Q04006 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.17□□□□□ -2.76
UPS3Q04006 YNL337WYNL337W 255 nt-2.17□□□□□ -2.76
UPS3Q04006 YKL225WYKL225W 348 nt-2.18□□□□□ -2.76
UPS3Q04006 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.23□□□□□ -2.77
UPS3Q04006 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.24□□□□□ -2.77
UPS3Q04006 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.27□□□□□ -2.77
UPS3Q04006 YDR543CYDR543C 300 nt-2.31□□□□□ -2.78
UPS3Q04006 snR85snR85 171 nt-2.38□□□□□ -2.79
UPS3Q04006 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.39□□□□□ -2.79
UPS3Q04006 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.44□□□□□ -2.8
UPS3Q04006 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.46□□□□□ -2.8
UPS3Q04006 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-2.48□□□□□ -2.81
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