Protein–RNA interactions for Protein: P53152

MMS2, Ubiquitin-conjugating enzyme variant MMS2, yeastyeast

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MMS2P53152 RDS3YPR094W 324 nt-1.39□□□□□ -2.63
MMS2P53152 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-1.4□□□□□ -2.63
MMS2P53152 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-1.42□□□□□ -2.64
MMS2P53152 RPL39YJL189W 156 nt-1.43□□□□□ -2.64
MMS2P53152 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.44□□□□□ -2.64
MMS2P53152 YFL019CYFL019C 354 nt-1.44□□□□□ -2.64
MMS2P53152 SKI7YOR076C 2244 nt-1.45□□□□□ -2.64
MMS2P53152 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-1.47□□□□□ -2.64
MMS2P53152 YEL014CYEL014C 306 nt-1.47□□□□□ -2.64
MMS2P53152 snR39BsnR39B 96 nt-1.48□□□□□ -2.65
MMS2P53152 YER181CYER181C 324 nt-1.49□□□□□ -2.65
MMS2P53152 YDR413CYDR413C 576 nt-1.5□□□□□ -2.65
MMS2P53152 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-1.51□□□□□ -2.65
MMS2P53152 snR67snR67 82 nt-1.53□□□□□ -2.65
MMS2P53152 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-1.54□□□□□ -2.66
MMS2P53152 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-1.56□□□□□ -2.66
MMS2P53152 YKL118WYKL118W 312 nt-1.57□□□□□ -2.66
MMS2P53152 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-1.58□□□□□ -2.66
MMS2P53152 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.61□□□□□ -2.67
MMS2P53152 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-1.62□□□□□ -2.67
MMS2P53152 VAR1Q0140 1197 nt-1.63□□□□□ -2.67
MMS2P53152 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.63□□□□□ -2.67
MMS2P53152 snR55snR55 98 nt-1.64□□□□□ -2.67
MMS2P53152 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.66□□□□□ -2.68
MMS2P53152 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.66□□□□□ -2.68
MMS2P53152 GIM4YEL003W 336 nt-1.67□□□□□ -2.68
MMS2P53152 YPR012WYPR012W 255 nt-1.67□□□□□ -2.68
MMS2P53152 YBR178WYBR178W 375 nt-1.68□□□□□ -2.68
MMS2P53152 YNL205CYNL205C 423 nt-1.69□□□□□ -2.68
MMS2P53152 snR77snR77 88 nt-1.7□□□□□ -2.68
MMS2P53152 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-1.71□□□□□ -2.68
MMS2P53152 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.72□□□□□ -2.68
MMS2P53152 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.73□□□□□ -2.69
MMS2P53152 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.76□□□□□ -2.69
MMS2P53152 snR81snR81 201 nt-1.79□□□□□ -2.7
MMS2P53152 snR48snR48 113 nt-1.82□□□□□ -2.7
MMS2P53152 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-1.83□□□□□ -2.7
MMS2P53152 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.89□□□□□ -2.71
MMS2P53152 YOR102WYOR102W 351 nt-1.9□□□□□ -2.71
MMS2P53152 YOR302WYOR302W 78 nt-1.91□□□□□ -2.72
MMS2P53152 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.92□□□□□ -2.72
MMS2P53152 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.93□□□□□ -2.72
MMS2P53152 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-1.95□□□□□ -2.72
MMS2P53152 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.95□□□□□ -2.72
MMS2P53152 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-1.97□□□□□ -2.72
MMS2P53152 snR65snR65 100 nt-1.98□□□□□ -2.73
MMS2P53152 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-2.03□□□□□ -2.73
MMS2P53152 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-2.03□□□□□ -2.73
MMS2P53152 snR52snR52 92 nt-2.05□□□□□ -2.74
MMS2P53152 YOR309CYOR309C 381 nt-2.09□□□□□ -2.74
MMS2P53152 Q0144Q0144 330 nt-2.11□□□□□ -2.75
MMS2P53152 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-2.11□□□□□ -2.75
MMS2P53152 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-2.19□□□□□ -2.76
MMS2P53152 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-2.19□□□□□ -2.76
MMS2P53152 YDR543CYDR543C 300 nt-2.2□□□□□ -2.76
MMS2P53152 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.22□□□□□ -2.76
MMS2P53152 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-2.28□□□□□ -2.77
MMS2P53152 YJL150WYJL150W 303 nt-2.28□□□□□ -2.77
MMS2P53152 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-2.29□□□□□ -2.78
MMS2P53152 YNL198CYNL198C 303 nt-2.29□□□□□ -2.78
MMS2P53152 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-2.34□□□□□ -2.78
MMS2P53152 snR80snR80 171 nt-2.35□□□□□ -2.79
MMS2P53152 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-2.37□□□□□ -2.79
MMS2P53152 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-2.37□□□□□ -2.79
MMS2P53152 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-2.38□□□□□ -2.79
MMS2P53152 Q0142Q0142 177 nt-2.4□□□□□ -2.79
MMS2P53152 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-2.42□□□□□ -2.8
MMS2P53152 snR56snR56 88 nt-2.44□□□□□ -2.8
MMS2P53152 SOM1YEL059C-A 225 nt-2.46□□□□□ -2.8
MMS2P53152 YBL053WYBL053W 375 nt-2.49□□□□□ -2.81
MMS2P53152 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-2.5□□□□□ -2.81
MMS2P53152 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-2.5□□□□□ -2.81
MMS2P53152 snR38snR38 95 nt-2.52□□□□□ -2.81
MMS2P53152 snR6snR6 112 nt-2.54□□□□□ -2.82
MMS2P53152 RPL41AYDL184C 78 nt-2.54□□□□□ -2.82
MMS2P53152 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-2.56□□□□□ -2.82
MMS2P53152 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-2.68□□□□□ -2.84
MMS2P53152 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.71□□□□□ -2.84
MMS2P53152 YGR151CYGR151C 336 nt-2.73□□□□□ -2.85
MMS2P53152 snR73snR73 106 nt-2.75□□□□□ -2.85
MMS2P53152 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-2.77□□□□□ -2.85
MMS2P53152 snR47snR47 99 nt-2.86□□□□□ -2.87
MMS2P53152 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.9□□□□□ -2.87
MMS2P53152 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.92□□□□□ -2.88
MMS2P53152 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-2.92□□□□□ -2.88
MMS2P53152 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-2.93□□□□□ -2.88
MMS2P53152 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-3□□□□□ -2.89
MMS2P53152 YJR162CYJR162C 351 nt-3.04□□□□□ -2.9
MMS2P53152 YNL337WYNL337W 255 nt-3.04□□□□□ -2.9
MMS2P53152 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-3.05□□□□□ -2.9
MMS2P53152 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-3.07□□□□□ -2.9
MMS2P53152 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-3.08□□□□□ -2.9
MMS2P53152 YKL225WYKL225W 348 nt-3.1□□□□□ -2.91
MMS2P53152 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-3.13□□□□□ -2.91
MMS2P53152 SPG3YDR504C 384 nt-3.16□□□□□ -2.92
MMS2P53152 snR85snR85 171 nt-3.17□□□□□ -2.92
MMS2P53152 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-3.3□□□□□ -2.94
MMS2P53152 snR87snR87 109 nt-3.37□□□□□ -2.95
MMS2P53152 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-3.37□□□□□ -2.95
MMS2P53152 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-3.46□□□□□ -2.96
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