Protein–RNA interactions for Protein: P34241

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 1,764 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URB1	P34241	YOR381W-A	YOR381W-A	168 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
URB1	P34241	YEL014C	YEL014C	306 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
URB1	P34241	YGL041C	YGL041C	204 nt		-1.82	□□□□□ -2.7
URB1	P34241	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		-1.82	□□□□□ -2.7
URB1	P34241	YAL068W-A	YAL068W-A	255 nt		-1.82	□□□□□ -2.7
URB1	P34241	YGR035C	YGR035C	351 nt		-1.84	□□□□□ -2.7
URB1	P34241	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		-1.85	□□□□□ -2.7
URB1	P34241	YOR293C-A	YOR293C-A	150 nt		-1.85	□□□□□ -2.7
URB1	P34241	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-1.85	□□□□□ -2.71
URB1	P34241	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-1.87	□□□□□ -2.71
URB1	P34241	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-1.87	□□□□□ -2.71
URB1	P34241	snR78	snR78	87 nt		-1.89	□□□□□ -2.71
URB1	P34241	YJR157W	YJR157W	363 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
URB1	P34241	ATP19	YOL077W-A	207 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
URB1	P34241	YDR413C	YDR413C	576 nt		-1.95	□□□□□ -2.72
URB1	P34241	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
URB1	P34241	YER181C	YER181C	324 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
URB1	P34241	YBR178W	YBR178W	375 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
URB1	P34241	YPR197C	YPR197C	564 nt		-1.98	□□□□□ -2.73
URB1	P34241	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-2.01	□□□□□ -2.73
URB1	P34241	YBR131C-A	YBR131C-A	90 nt		-2.03	□□□□□ -2.73
URB1	P34241	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		-2.04	□□□□□ -2.74
URB1	P34241	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-2.04	□□□□□ -2.74
URB1	P34241	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
URB1	P34241	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
URB1	P34241	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-2.07	□□□□□ -2.74
URB1	P34241	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-2.08	□□□□□ -2.74
URB1	P34241	YKL118W	YKL118W	312 nt		-2.1	□□□□□ -2.75
URB1	P34241	snR55	snR55	98 nt		-2.11	□□□□□ -2.75
URB1	P34241	YOR102W	YOR102W	351 nt		-2.11	□□□□□ -2.75
URB1	P34241	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-2.13	□□□□□ -2.75
URB1	P34241	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		-2.19	□□□□□ -2.76
URB1	P34241	RPL39	YJL189W	156 nt		-2.2	□□□□□ -2.76
URB1	P34241	YOR309C	YOR309C	381 nt		-2.2	□□□□□ -2.76
URB1	P34241	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		-2.22	□□□□□ -2.76
URB1	P34241	YDR157W	YDR157W	402 nt		-2.23	□□□□□ -2.77
URB1	P34241	snR48	snR48	113 nt		-2.28	□□□□□ -2.78
URB1	P34241	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-2.3	□□□□□ -2.78
URB1	P34241	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		-2.31	□□□□□ -2.78
URB1	P34241	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-2.32	□□□□□ -2.78
URB1	P34241	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-2.33	□□□□□ -2.78
URB1	P34241	YNL198C	YNL198C	303 nt		-2.37	□□□□□ -2.79
URB1	P34241	YOR302W	YOR302W	78 nt		-2.38	□□□□□ -2.79
URB1	P34241	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-2.38	□□□□□ -2.79
URB1	P34241	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-2.39	□□□□□ -2.79
URB1	P34241	RPL41A	YDL184C	78 nt		-2.41	□□□□□ -2.8
URB1	P34241	YDR543C	YDR543C	300 nt		-2.41	□□□□□ -2.8
URB1	P34241	YJL150W	YJL150W	303 nt		-2.42	□□□□□ -2.8
URB1	P34241	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-2.44	□□□□□ -2.8
URB1	P34241	Q0017	Q0017	162 nt		-2.44	□□□□□ -2.8
URB1	P34241	GIM4	YEL003W	336 nt		-2.47	□□□□□ -2.8
URB1	P34241	YPR012W	YPR012W	255 nt		-2.47	□□□□□ -2.8
URB1	P34241	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-2.49	□□□□□ -2.81
URB1	P34241	snR52	snR52	92 nt		-2.49	□□□□□ -2.81
URB1	P34241	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-2.5	□□□□□ -2.81
URB1	P34241	snR56	snR56	88 nt		-2.54	□□□□□ -2.82
URB1	P34241	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-2.54	□□□□□ -2.82
URB1	P34241	snR80	snR80	171 nt		-2.56	□□□□□ -2.82
URB1	P34241	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-2.56	□□□□□ -2.82
URB1	P34241	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-2.57	□□□□□ -2.82
URB1	P34241	YDR118W-A	YDR118W-A	117 nt		-2.61	□□□□□ -2.83
URB1	P34241	snR38	snR38	95 nt		-2.62	□□□□□ -2.83
URB1	P34241	Q0142	Q0142	177 nt		-2.63	□□□□□ -2.83
URB1	P34241	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-2.63	□□□□□ -2.83
URB1	P34241	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-2.65	□□□□□ -2.83
URB1	P34241	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-2.65	□□□□□ -2.83
URB1	P34241	snR6	snR6	112 nt		-2.69	□□□□□ -2.84
URB1	P34241	snR65	snR65	100 nt		-2.74	□□□□□ -2.85
URB1	P34241	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-2.77	□□□□□ -2.85
URB1	P34241	VAR1	Q0140	1197 nt		-2.79	□□□□□ -2.86
URB1	P34241	YGR151C	YGR151C	336 nt		-2.82	□□□□□ -2.86
URB1	P34241	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-2.82	□□□□□ -2.86
URB1	P34241	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-2.83	□□□□□ -2.86
URB1	P34241	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-2.85	□□□□□ -2.87
URB1	P34241	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-2.86	□□□□□ -2.87
URB1	P34241	snR47	snR47	99 nt		-2.87	□□□□□ -2.87
URB1	P34241	snR73	snR73	106 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
URB1	P34241	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
URB1	P34241	YDR524C-A	YDR524C-A	120 nt		-2.98	□□□□□ -2.89
URB1	P34241	YBL053W	YBL053W	375 nt		-2.98	□□□□□ -2.89
URB1	P34241	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-3	□□□□□ -2.89
URB1	P34241	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-3.01	□□□□□ -2.89
URB1	P34241	snR85	snR85	171 nt		-3.07	□□□□□ -2.9
URB1	P34241	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-3.08	□□□□□ -2.9
URB1	P34241	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-3.16	□□□□□ -2.92
URB1	P34241	YKL225W	YKL225W	348 nt		-3.17	□□□□□ -2.92
URB1	P34241	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-3.22	□□□□□ -2.92
URB1	P34241	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-3.22	□□□□□ -2.92
URB1	P34241	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-3.34	□□□□□ -2.94
URB1	P34241	YJR162C	YJR162C	351 nt		-3.34	□□□□□ -2.94
URB1	P34241	YNL337W	YNL337W	255 nt		-3.34	□□□□□ -2.94
URB1	P34241	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-3.35	□□□□□ -2.95
URB1	P34241	SPG3	YDR504C	384 nt		-3.38	□□□□□ -2.95
URB1	P34241	snR87	snR87	109 nt		-3.45	□□□□□ -2.96
URB1	P34241	snR58	snR58	96 nt		-3.46	□□□□□ -2.96
URB1	P34241	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-3.46	□□□□□ -2.96
URB1	P34241	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-3.48	□□□□□ -2.97
URB1	P34241	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-3.53	□□□□□ -2.97
URB1	P34241	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		-3.6	□□□□□ -2.99
URB1	P34241	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-3.62	□□□□□ -2.99

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