Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms