Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PAOX-207ENST00000483211 995 ntTSL 1 (best)24.38■■□□□ 1.492e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 PAOX-209ENST00000529585 837 ntTSL 1 (best)24.38■■□□□ 1.492e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 PAOX-202ENST00000356306 1482 ntTSL 1 (best)23.77■■□□□ 1.42e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.942e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-208ENST00000526537 2519 ntTSL 218.47■□□□□ 0.552e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 ADGRD1-204ENST00000446583 5529 ntTSL 516.32■□□□□ 0.22e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 STAG3-209ENST00000451963 3056 ntTSL 215.84■□□□□ 0.139e-24■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 ADGRD1-209ENST00000540207 718 ntTSL 315.73■□□□□ 0.112e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 AC004890.2-206ENST00000480864 1220 ntTSL 215.16■□□□□ 0.022e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 TARS2-212ENST00000480070 832 ntTSL 514.98□□□□□ -0.012e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.129e-24■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.22e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 ADGRD1-207ENST00000537489 565 ntTSL 413.39□□□□□ -0.272e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 ADGRD1-213ENST00000543617 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.392e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 TARS2-208ENST00000463555 852 ntTSL 512.42□□□□□ -0.422e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-227ENST00000620788 5898 ntTSL 212.23□□□□□ -0.452e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 ABCB8-214ENST00000482899 3743 ntTSL 212.07□□□□□ -0.482e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H12C-203ENST00000528673 2931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.492e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 PHACTR1-201ENST00000332995 5332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.52e-11■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 STAG3-218ENST00000615138 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.539e-24■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 STAG3-208ENST00000440830 3121 ntTSL 511.62□□□□□ -0.559e-24■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 STAG3-201ENST00000317296 4198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.569e-24■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 STAG3-215ENST00000491498 3031 ntTSL 510.95□□□□□ -0.669e-24■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 TLN2-208ENST00000561197 306 ntTSL 510.85□□□□□ -0.672e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 STAG3-217ENST00000496157 3585 ntTSL 1 (best)10.65□□□□□ -0.719e-24■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 DAP3-222ENST00000496863 742 ntTSL 210.25□□□□□ -0.772e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 STAG3-219ENST00000620100 4203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.89e-24■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 NAE1-205ENST00000561579 728 ntTSL 59.97□□□□□ -0.812e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 DAP3-205ENST00000462002 716 ntTSL 39.9□□□□□ -0.822e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 STAG3-202ENST00000394018 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.859e-24■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.852e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 STAG3-203ENST00000412190 920 ntTSL 39.63□□□□□ -0.879e-24■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 DAP3-211ENST00000470830 439 ntTSL 39.23□□□□□ -0.932e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 TAOK3-209ENST00000537952 2147 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.972e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 TARS2-207ENST00000462578 609 ntTSL 38.8□□□□□ -12e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 TAOK3-219ENST00000543709 597 ntTSL 38.57□□□□□ -1.042e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 CPD-203ENST00000579502 672 ntTSL 58.48□□□□□ -1.052e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 TARS2-206ENST00000460794 568 ntTSL 28.42□□□□□ -1.062e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.172e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 WIPF2-205ENST00000578623 554 ntTSL 27.56□□□□□ -1.22e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 TPM4-214ENST00000591645 653 ntTSL 37.46□□□□□ -1.222e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 RAD18-206ENST00000427329 557 ntTSL 37.45□□□□□ -1.222e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.262e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 CPD-208ENST00000584051 575 ntTSL 56.17□□□□□ -1.422e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 TAOK3-206ENST00000537305 3932 ntTSL 56.12□□□□□ -1.432e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.512e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.882e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 PES1-212ENST00000488719 1732 ntTSL 219.9■□□□□ 0.782e-9■■■■■ 632
UTP3Q9NQZ2 PES1-208ENST00000441668 999 ntTSL 315.91■□□□□ 0.142e-9■■■■■ 632
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UTP3Q9NQZ2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.719e-8■■■■■ 628.2
UTP3Q9NQZ2 PLEKHG4-203ENST00000393966 2182 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.039e-8■■■■■ 628.2
UTP3Q9NQZ2 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.159e-8■■■■■ 628.2
UTP3Q9NQZ2 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.189e-8■■■■■ 628.2
UTP3Q9NQZ2 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.661e-12■■■■■ 627.7
UTP3Q9NQZ2 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.741e-12■■■■■ 627.7
UTP3Q9NQZ2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 621.6
UTP3Q9NQZ2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 621.6
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UTP3Q9NQZ2 RGS12-222ENST00000513784 710 ntTSL 217.67■□□□□ 0.428e-7■■■■■ 621.1
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UTP3Q9NQZ2 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.158e-7■■■■■ 621.1
UTP3Q9NQZ2 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.028e-7■■■■■ 621.1
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UTP3Q9NQZ2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-8■■■■■ 620
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UTP3Q9NQZ2 CANT1-201ENST00000302345 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 620
UTP3Q9NQZ2 CANT1-202ENST00000392446 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 620
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-210ENST00000518480 558 ntTSL 417.67■□□□□ 0.425e-8■■■■■ 616.7
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UTP3Q9NQZ2 NDRG1-211ENST00000519228 729 ntTSL 416.08■□□□□ 0.165e-8■■■■■ 616.7
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-214ENST00000520230 582 ntTSL 414.21□□□□□ -0.135e-8■■■■■ 616.7
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-206ENST00000518010 581 ntTSL 414.15□□□□□ -0.145e-8■■■■■ 616.7
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-213ENST00000519580 550 ntTSL 513.59□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 616.7
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-219ENST00000521544 709 ntTSL 513.59□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 616.7
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-221ENST00000522377 1103 ntTSL 513.13□□□□□ -0.315e-8■■■■■ 616.7
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-224ENST00000522738 530 ntTSL 512.19□□□□□ -0.465e-8■■■■■ 616.7
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-215ENST00000520943 536 ntTSL 410.65□□□□□ -0.75e-8■■■■■ 616.7
UTP3Q9NQZ2 PIGU-203ENST00000438215 509 ntTSL 39.68□□□□□ -0.863e-50■■■■■ 614.9
UTP3Q9NQZ2 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 614.1
UTP3Q9NQZ2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 612.3
UTP3Q9NQZ2 APEH-216ENST00000491799 733 ntTSL 321.08■□□□□ 0.971e-9■■■■■ 610.2
UTP3Q9NQZ2 APEH-211ENST00000463995 1024 ntTSL 519.73■□□□□ 0.751e-9■■■■■ 610.2
UTP3Q9NQZ2 APEH-209ENST00000462439 829 ntTSL 219.22■□□□□ 0.671e-9■■■■■ 610.2
UTP3Q9NQZ2 APEH-208ENST00000457042 853 ntTSL 518.1■□□□□ 0.491e-9■■■■■ 610.2
UTP3Q9NQZ2 APEH-203ENST00000442186 924 ntTSL 517.5■□□□□ 0.391e-9■■■■■ 610.2
UTP3Q9NQZ2 APEH-207ENST00000449966 825 ntTSL 317.5■□□□□ 0.391e-9■■■■■ 610.2
UTP3Q9NQZ2 APEH-205ENST00000447436 963 ntTSL 517.44■□□□□ 0.381e-9■■■■■ 610.2
UTP3Q9NQZ2 APEH-204ENST00000446089 855 ntTSL 514.84□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 610.2
UTP3Q9NQZ2 APEH-215ENST00000483715 1055 ntTSL 313.93□□□□□ -0.181e-9■■■■■ 610.2
UTP3Q9NQZ2 TNIP2-204ENST00000505186 980 ntTSL 319.32■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 606.4
UTP3Q9NQZ2 TNIP2-202ENST00000502256 923 ntTSL 217.2■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 606.4
UTP3Q9NQZ2 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 605.2
UTP3Q9NQZ2 NEK6-209ENST00000444973 790 ntTSL 529.94■■■□□ 2.384e-7■■■■■ 601.6
UTP3Q9NQZ2 NEK6-211ENST00000454453 732 ntTSL 326.88■■□□□ 1.894e-7■■■■■ 601.6
UTP3Q9NQZ2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.434e-7■■■■■ 601.6
UTP3Q9NQZ2 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 601.6
UTP3Q9NQZ2 NEK6-203ENST00000373600 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 601.6
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3976.7 ms