Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSU72Q9NP77 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSU72Q9NP77 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSU72Q9NP77 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSU72Q9NP77 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms