Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rprd2Q6NXI6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Rprd2Q6NXI6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rprd2Q6NXI6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Rprd2Q6NXI6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rprd2Q6NXI6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rprd2Q6NXI6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Rprd2Q6NXI6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rprd2Q6NXI6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rprd2Q6NXI6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rprd2Q6NXI6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rprd2Q6NXI6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rprd2Q6NXI6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rprd2Q6NXI6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rprd2Q6NXI6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rprd2Q6NXI6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rprd2Q6NXI6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rprd2Q6NXI6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rprd2Q6NXI6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rprd2Q6NXI6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rprd2Q6NXI6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Rprd2Q6NXI6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rprd2Q6NXI6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rprd2Q6NXI6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rprd2Q6NXI6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rprd2Q6NXI6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rprd2Q6NXI6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rprd2Q6NXI6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rprd2Q6NXI6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rprd2Q6NXI6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rprd2Q6NXI6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rprd2Q6NXI6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rprd2Q6NXI6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rprd2Q6NXI6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rprd2Q6NXI6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rprd2Q6NXI6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rprd2Q6NXI6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rprd2Q6NXI6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rprd2Q6NXI6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rprd2Q6NXI6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rprd2Q6NXI6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rprd2Q6NXI6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rprd2Q6NXI6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rprd2Q6NXI6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Rprd2Q6NXI6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rprd2Q6NXI6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rprd2Q6NXI6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rprd2Q6NXI6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rprd2Q6NXI6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rprd2Q6NXI6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms