Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 RCR1YBR005W 642 nt8.85□□□□□ -0.99
CTF3Q12748 CRC1YOR100C 984 nt8.85□□□□□ -0.99
CTF3Q12748 RPN14YGL004C 1254 nt8.84□□□□□ -0.99
CTF3Q12748 HEL2YDR266C 1920 nt8.84□□□□□ -1
CTF3Q12748 FCY1YPR062W 477 nt8.83□□□□□ -1
CTF3Q12748 ZAP1YJL056C 2643 nt8.82□□□□□ -1
CTF3Q12748 SNX3YOR357C 489 nt8.81□□□□□ -1
CTF3Q12748 SAN1YDR143C 1833 nt8.8□□□□□ -1
CTF3Q12748 RPD3YNL330C 1302 nt8.79□□□□□ -1
CTF3Q12748 BUD20YLR074C 501 nt8.78□□□□□ -1
CTF3Q12748 KGD2YDR148C 1392 nt8.76□□□□□ -1.01
CTF3Q12748 YFR020WYFR020W 699 nt8.76□□□□□ -1.01
CTF3Q12748 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.75□□□□□ -1.01
CTF3Q12748 YPT11YNL304W 1254 nt8.75□□□□□ -1.01
CTF3Q12748 YPL108WYPL108W 507 nt8.75□□□□□ -1.01
CTF3Q12748 RIM2YBR192W 1134 nt8.75□□□□□ -1.01
CTF3Q12748 RIM8YGL045W 1629 nt8.75□□□□□ -1.01
CTF3Q12748 UGP1YKL035W 1500 nt8.73□□□□□ -1.01
CTF3Q12748 HIS2YFR025C 1008 nt8.72□□□□□ -1.01
CTF3Q12748 GAS1YMR307W 1680 nt8.7□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 YJL160CYJL160C 864 nt8.7□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 PTC6YCR079W 1329 nt8.7□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 SBP1YHL034C 885 nt8.69□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 EMC3YKL207W 762 nt8.69□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 PAU21YOR394W 495 nt8.69□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 PAU22YPL282C 495 nt8.69□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 SSL2YIL143C 2532 nt8.69□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 YGL114WYGL114W 2178 nt8.68□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 GRH1YDR517W 1119 nt8.67□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 RSM7YJR113C 744 nt8.67□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 LSP1YPL004C 1026 nt8.67□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 YMR210WYMR210W 1350 nt8.66□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 YOR343CYOR343C 327 nt8.66□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 MAS1YLR163C 1389 nt8.65□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 CWP2YKL096W-A 279 nt8.65□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 RPC31YNL151C 756 nt8.65□□□□□ -1.02
CTF3Q12748 HRA1HRA1 564 nt8.64□□□□□ -1.03
CTF3Q12748 YMR166CYMR166C 1107 nt8.64□□□□□ -1.03
CTF3Q12748 KRR1YCL059C 951 nt8.63□□□□□ -1.03
CTF3Q12748 ODC1YPL134C 933 nt8.62□□□□□ -1.03
CTF3Q12748 DPL1YDR294C 1770 nt8.62□□□□□ -1.03
CTF3Q12748 PET18YCR020C 648 nt8.61□□□□□ -1.03
CTF3Q12748 GID7YCL039W 2238 nt8.61□□□□□ -1.03
CTF3Q12748 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.59□□□□□ -1.03
CTF3Q12748 YLR460CYLR460C 1131 nt8.58□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 MRP1YDR347W 966 nt8.57□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 RPL12BYDR418W 498 nt8.57□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 CAK1YFL029C 1107 nt8.57□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 THI3YDL080C 1830 nt8.57□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 RRT14YIL127C 621 nt8.56□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 MAE1YKL029C 2010 nt8.56□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 GGA2YHR108W 1758 nt8.56□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 UTR5YEL035C 501 nt8.55□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 MCM5YLR274W 2328 nt8.55□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 OCH1YGL038C 1443 nt8.54□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.54□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 MET22YOL064C 1074 nt8.54□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 CHS7YHR142W 951 nt8.53□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 MFT1YML062C 1179 nt8.53□□□□□ -1.04
CTF3Q12748 GDH1YOR375C 1365 nt8.52□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 GPM1YKL152C 744 nt8.52□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 ADA2YDR448W 1305 nt8.52□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 MDM35YKL053C-A 261 nt8.51□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 YER156CYER156C 1017 nt8.5□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 YJR149WYJR149W 1215 nt8.5□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 LEU4YNL104C 1860 nt8.5□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 YDR467CYDR467C 327 nt8.49□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 OLA1YBR025C 1185 nt8.49□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 ESBP6YNL125C 2022 nt8.49□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 PDC6YGR087C 1692 nt8.49□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.48□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.48□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.48□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.48□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.48□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.48□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.48□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 RNA170RNA170 169 nt8.47□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 BXI1YNL305C 894 nt8.47□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 RPS6AYPL090C 711 nt8.47□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 RPS6BYBR181C 711 nt8.47□□□□□ -1.05
CTF3Q12748 HEM14YER014W 1620 nt8.46□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 TAD2YJL035C 753 nt8.45□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 KAE1YKR038C 1161 nt8.45□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 YOR268CYOR268C 399 nt8.45□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 ELP4YPL101W 1371 nt8.45□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 YPR084WYPR084W 1371 nt8.45□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 YMR209CYMR209C 1374 nt8.44□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 YIR035CYIR035C 765 nt8.43□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 AAC3YBR085W 924 nt8.42□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 DMA2YNL116W 1569 nt8.41□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.41□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.41□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 YMR206WYMR206W 942 nt8.41□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 YBL095WYBL095W 813 nt8.41□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 TMS1YDR105C 1422 nt8.4□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 TOS1YBR162C 1368 nt8.4□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 YPT31YER031C 672 nt8.4□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 EDC2YER035W 438 nt8.4□□□□□ -1.06
CTF3Q12748 YMC2YBR104W 990 nt8.4□□□□□ -1.06
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