Protein–RNA interactions for Protein: Q12462

PEX11, Peroxisomal membrane protein PMP27, yeastyeast

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX11Q12462 KGD2YDR148C 1392 nt8.35□□□□□ -1.07
PEX11Q12462 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.35□□□□□ -1.07
PEX11Q12462 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.35□□□□□ -1.07
PEX11Q12462 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.35□□□□□ -1.07
PEX11Q12462 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.35□□□□□ -1.07
PEX11Q12462 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.35□□□□□ -1.07
PEX11Q12462 RIM2YBR192W 1134 nt8.35□□□□□ -1.07
PEX11Q12462 RCR1YBR005W 642 nt8.34□□□□□ -1.07
PEX11Q12462 SSL2YIL143C 2532 nt8.33□□□□□ -1.08
PEX11Q12462 YPT11YNL304W 1254 nt8.33□□□□□ -1.08
PEX11Q12462 CWP2YKL096W-A 279 nt8.32□□□□□ -1.08
PEX11Q12462 POP2YNR052C 1302 nt8.31□□□□□ -1.08
PEX11Q12462 YFR020WYFR020W 699 nt8.31□□□□□ -1.08
PEX11Q12462 FCY1YPR062W 477 nt8.31□□□□□ -1.08
PEX11Q12462 KRR1YCL059C 951 nt8.3□□□□□ -1.08
PEX11Q12462 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.3□□□□□ -1.08
PEX11Q12462 RPC31YNL151C 756 nt8.29□□□□□ -1.08
PEX11Q12462 GAS1YMR307W 1680 nt8.29□□□□□ -1.08
PEX11Q12462 PTC6YCR079W 1329 nt8.29□□□□□ -1.08
PEX11Q12462 SBP1YHL034C 885 nt8.28□□□□□ -1.08
PEX11Q12462 YPL108WYPL108W 507 nt8.27□□□□□ -1.09
PEX11Q12462 ODC1YPL134C 933 nt8.27□□□□□ -1.09
PEX11Q12462 RSM7YJR113C 744 nt8.25□□□□□ -1.09
PEX11Q12462 DPL1YDR294C 1770 nt8.25□□□□□ -1.09
PEX11Q12462 YJL160CYJL160C 864 nt8.21□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 BUD20YLR074C 501 nt8.21□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 LSP1YPL004C 1026 nt8.2□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 RIM8YGL045W 1629 nt8.2□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 YMR166CYMR166C 1107 nt8.19□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 YGL114WYGL114W 2178 nt8.19□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 GGA2YHR108W 1758 nt8.18□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 MDM35YKL053C-A 261 nt8.18□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 EMC3YKL207W 762 nt8.18□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 THI3YDL080C 1830 nt8.17□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 HEL2YDR266C 1920 nt8.17□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 YLR460CYLR460C 1131 nt8.16□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 YMR210WYMR210W 1350 nt8.16□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.16□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 GRH1YDR517W 1119 nt8.15□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 PAU21YOR394W 495 nt8.15□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 PAU22YPL282C 495 nt8.15□□□□□ -1.1
PEX11Q12462 GPM1YKL152C 744 nt8.14□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 LEU4YNL104C 1860 nt8.14□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 YMR209CYMR209C 1374 nt8.12□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 PET18YCR020C 648 nt8.12□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 YDR467CYDR467C 327 nt8.12□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 CAK1YFL029C 1107 nt8.12□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 RRT14YIL127C 621 nt8.12□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 MET22YOL064C 1074 nt8.12□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 YOR343CYOR343C 327 nt8.12□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 CHS7YHR142W 951 nt8.11□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 HRA1HRA1 564 nt8.11□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 OCH1YGL038C 1443 nt8.11□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 DMA2YNL116W 1569 nt8.1□□□□□ -1.11
PEX11Q12462 BSP1YPR171W 1731 nt8.07□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 MRP1YDR347W 966 nt8.07□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 OLA1YBR025C 1185 nt8.07□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 PDC6YGR087C 1692 nt8.06□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 MFT1YML062C 1179 nt8.06□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 INH1YDL181W 258 nt8.05□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.05□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.05□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 UTR5YEL035C 501 nt8.05□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 YER156CYER156C 1017 nt8.05□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 YIR035CYIR035C 765 nt8.05□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 RNA170RNA170 169 nt8.05□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 YBL095WYBL095W 813 nt8.05□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 AAC3YBR085W 924 nt8.05□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 HXT10YFL011W 1641 nt8.04□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.04□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 ADA2YDR448W 1305 nt8.03□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 GDH1YOR375C 1365 nt8.03□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 RPL12BYDR418W 498 nt8.03□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 YMC2YBR104W 990 nt8.03□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 TMS1YDR105C 1422 nt8.03□□□□□ -1.12
PEX11Q12462 GID7YCL039W 2238 nt8.01□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 YJR149WYJR149W 1215 nt8.01□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 MRS4YKR052C 915 nt8.01□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 BXI1YNL305C 894 nt8.01□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 RPS6AYPL090C 711 nt8.01□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 RPS6BYBR181C 711 nt8.01□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 YPR084WYPR084W 1371 nt8□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 AGP3YFL055W 1677 nt7.99□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 BUB2YMR055C 921 nt7.99□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 NPP2YEL016C 1482 nt7.99□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 YPT31YER031C 672 nt7.98□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 TAD2YJL035C 753 nt7.98□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 YHR218WYHR218W 1812 nt7.98□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.97□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.97□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.97□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.97□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.97□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.97□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.97□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 YJL009WYJL009W 327 nt7.97□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 YMR206WYMR206W 942 nt7.97□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 RHO1YPR165W 630 nt7.97□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 PSD1YNL169C 1503 nt7.97□□□□□ -1.13
PEX11Q12462 ELP4YPL101W 1371 nt7.97□□□□□ -1.13
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