Protein–RNA interactions for Protein: Q12301

YDL180W, Uncharacterized membrane protein YDL180W, yeastyeast

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL180WQ12301 CRC1YOR100C 984 nt7.34□□□□□ -1.23
YDL180WQ12301 SAM50YNL026W 1455 nt7.34□□□□□ -1.23
YDL180WQ12301 ILV2YMR108W 2064 nt7.34□□□□□ -1.23
YDL180WQ12301 ENO1YGR254W 1314 nt7.33□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 YIA6YIL006W 1122 nt7.33□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 SRP102YKL154W 735 nt7.33□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 SRP54YPR088C 1626 nt7.33□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 YKL053WYKL053W 375 nt7.32□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 RIB1YBL033C 1038 nt7.32□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 YHL008CYHL008C 1884 nt7.32□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 SER2YGR208W 930 nt7.31□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 YPT11YNL304W 1254 nt7.31□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 HTS1YPR033C 1641 nt7.3□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 LYS20YDL182W 1287 nt7.3□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 SWM1YDR260C 513 nt7.3□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 CYT1YOR065W 930 nt7.3□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 VBA3YCL069W 1377 nt7.3□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 SAN1YDR143C 1833 nt7.29□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 RPC31YNL151C 756 nt7.28□□□□□ -1.24
YDL180WQ12301 DTR1YBR180W 1719 nt7.27□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 YHR218WYHR218W 1812 nt7.27□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 YMR007WYMR007W 381 nt7.27□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 RIM2YBR192W 1134 nt7.27□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 HXK1YFR053C 1458 nt7.26□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 KGD2YDR148C 1392 nt7.26□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 SOD2YHR008C 702 nt7.26□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 YLR280CYLR280C 351 nt7.26□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 ERO1YML130C 1692 nt7.25□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 SBP1YHL034C 885 nt7.25□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 MDM35YKL053C-A 261 nt7.24□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 RCR1YBR005W 642 nt7.24□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 HEM14YER014W 1620 nt7.23□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 RFC1YOR217W 2586 nt7.23□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 GAS1YMR307W 1680 nt7.22□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 YFR020WYFR020W 699 nt7.22□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 YGR210CYGR210C 1236 nt7.22□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 RSM7YJR113C 744 nt7.22□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 ERG6YML008C 1152 nt7.22□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 URA8YJR103W 1737 nt7.21□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 ALD5YER073W 1563 nt7.21□□□□□ -1.25
YDL180WQ12301 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.21□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.21□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.21□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 HXT10YFL011W 1641 nt7.2□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 PTC6YCR079W 1329 nt7.2□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.19□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.19□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.19□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.19□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.19□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 DPL1YDR294C 1770 nt7.18□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 GTB1YDR221W 2109 nt7.18□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 YPL108WYPL108W 507 nt7.17□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 GGA2YHR108W 1758 nt7.17□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 FCY1YPR062W 477 nt7.16□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 POP2YNR052C 1302 nt7.16□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.15□□□□□ -1.26
YDL180WQ12301 YLR460CYLR460C 1131 nt7.14□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 YMR166CYMR166C 1107 nt7.14□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 YDR467CYDR467C 327 nt7.13□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 GPM1YKL152C 744 nt7.13□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 AGP3YFL055W 1677 nt7.12□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 GAL2YLR081W 1725 nt7.12□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 THI3YDL080C 1830 nt7.11□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 INH1YDL181W 258 nt7.11□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.11□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 YOR072WYOR072W 315 nt7.11□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 YIL177CYIL177C 5277 nt7.1□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 CHS7YHR142W 951 nt7.1□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 LEU4YNL104C 1860 nt7.1□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 YJL160CYJL160C 864 nt7.09□□□□□ -1.27
YDL180WQ12301 RSC4YKR008W 1878 nt7.09□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.08□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.08□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 YIR035CYIR035C 765 nt7.08□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 YBL095WYBL095W 813 nt7.08□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 LSP1YPL004C 1026 nt7.08□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 RRT14YIL127C 621 nt7.07□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 AAC3YBR085W 924 nt7.07□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 MCM5YLR274W 2328 nt7.06□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 OLA1YBR025C 1185 nt7.06□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 TMS1YDR105C 1422 nt7.06□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 OCH1YGL038C 1443 nt7.05□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 CAK1YFL029C 1107 nt7.05□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 TOK1YJL093C 2076 nt7.04□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 EMC3YKL207W 762 nt7.04□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 MET22YOL064C 1074 nt7.04□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 NBA1YOL070C 1506 nt7.04□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 YMC2YBR104W 990 nt7.03□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 YMR210WYMR210W 1350 nt7.03□□□□□ -1.28
YDL180WQ12301 GRH1YDR517W 1119 nt7.02□□□□□ -1.29
YDL180WQ12301 MRS4YKR052C 915 nt7.02□□□□□ -1.29
YDL180WQ12301 PDC6YGR087C 1692 nt7.02□□□□□ -1.29
YDL180WQ12301 BUD20YLR074C 501 nt7.01□□□□□ -1.29
YDL180WQ12301 BUB2YMR055C 921 nt7.01□□□□□ -1.29
YDL180WQ12301 PAU21YOR394W 495 nt7.01□□□□□ -1.29
YDL180WQ12301 PAU22YPL282C 495 nt7.01□□□□□ -1.29
YDL180WQ12301 PET18YCR020C 648 nt7□□□□□ -1.29
YDL180WQ12301 YER156CYER156C 1017 nt7□□□□□ -1.29
YDL180WQ12301 HRA1HRA1 564 nt7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms