Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 YDR306CYDR306C 1437 nt8.25□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 GGA2YHR108W 1758 nt8.25□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 THI3YDL080C 1830 nt8.24□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 MRS4YKR052C 915 nt8.24□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 MET8YBR213W 825 nt8.24□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 MET1YKR069W 1782 nt8.24□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 HSV2YGR223C 1347 nt8.24□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 DIA4YHR011W 1341 nt8.24□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 KGD2YDR148C 1392 nt8.23□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 GAL3YDR009W 1563 nt8.23□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 RIB3YDR487C 627 nt8.23□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 ECM10YEL030W 1935 nt8.23□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 ESS1YJR017C 513 nt8.22□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.21□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 MAM3YOL060C 2121 nt8.2□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 YLR111WYLR111W 333 nt8.2□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 MDH2YOL126C 1134 nt8.2□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 LEA1YPL213W 717 nt8.2□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 Q0010Q0010 387 nt8.2□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 SWT21YNL187W 1074 nt8.19□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 CAB5YDR196C 726 nt8.18□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.18□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 YLR072WYLR072W 2082 nt8.18□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 MET30YIL046W 1923 nt8.17□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 SBP1YHL034C 885 nt8.17□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 YKL053WYKL053W 375 nt8.17□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 PAU21YOR394W 495 nt8.17□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 PAU22YPL282C 495 nt8.17□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 snR86snR86 1004 nt8.16□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 TVP23YDR084C 600 nt8.16□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.16□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 SLM3YDL033C 1254 nt8.15□□□□□ -1.1
TAF3Q12297 YNL190WYNL190W 615 nt8.13□□□□□ -1.11
TAF3Q12297 ARO7YPR060C 771 nt8.12□□□□□ -1.11
TAF3Q12297 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.12□□□□□ -1.11
TAF3Q12297 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.12□□□□□ -1.11
TAF3Q12297 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.12□□□□□ -1.11
TAF3Q12297 RIB2YOL066C 1776 nt8.12□□□□□ -1.11
TAF3Q12297 ENO2YHR174W 1314 nt8.11□□□□□ -1.11
TAF3Q12297 YJR154WYJR154W 1041 nt8.11□□□□□ -1.11
TAF3Q12297 ABP1YCR088W 1779 nt8.1□□□□□ -1.11
TAF3Q12297 AIM34YMR003W 597 nt8.09□□□□□ -1.11
TAF3Q12297 HIS3YOR202W 663 nt8.09□□□□□ -1.11
TAF3Q12297 AAC3YBR085W 924 nt8.08□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 AMF1YOR378W 1548 nt8.08□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 SPS100YHR139C 981 nt8.07□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 SAN1YDR143C 1833 nt8.07□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 YEL023CYEL023C 2049 nt8.07□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 YJL009WYJL009W 327 nt8.06□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.06□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 YPL264CYPL264C 1062 nt8.06□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 PMT7YDR307W 1989 nt8.05□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 CHA1YCL064C 1083 nt8.05□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 NDE2YDL085W 1638 nt8.04□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 YIL177CYIL177C 5277 nt8.04□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 LYS20YDL182W 1287 nt8.04□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 ABZ2YMR289W 1125 nt8.04□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 PUS7YOR243C 2031 nt8.03□□□□□ -1.12
TAF3Q12297 PRC1YMR297W 1599 nt8.02□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 LAS17YOR181W 1902 nt8.02□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 YMR226CYMR226C 804 nt8.02□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 NDE1YMR145C 1683 nt8.02□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 SPE4YLR146C 903 nt8.01□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 GAS1YMR307W 1680 nt8.01□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 TMS1YDR105C 1422 nt8□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 SRP54YPR088C 1626 nt8□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 ITR1YDR497C 1755 nt7.99□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.99□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 YPI1YFR003C 468 nt7.99□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 ATP10YLR393W 840 nt7.99□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 SNZ1YMR096W 894 nt7.99□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 YNL140CYNL140C 570 nt7.99□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 PTC6YCR079W 1329 nt7.99□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 TIF3YPR163C 1311 nt7.99□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 PAR32YDL173W 888 nt7.98□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 ERG6YML008C 1152 nt7.98□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 YPR126CYPR126C 309 nt7.98□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 IML3YBR107C 738 nt7.98□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 FRT1YOR324C 1809 nt7.97□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 PMA2YPL036W 2844 nt7.97□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 MEP1YGR121C 1479 nt7.97□□□□□ -1.13
TAF3Q12297 STF1YDL130W-A 261 nt7.96□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 TPC1YGR096W 945 nt7.96□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 BEM1YBR200W 1656 nt7.95□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 GLR1YPL091W 1452 nt7.95□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 INO1YJL153C 1602 nt7.95□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 WSC4YHL028W 1818 nt7.94□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 CCR4YAL021C 2514 nt7.94□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 YJL045WYJL045W 1905 nt7.94□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 RRT6YGL146C 936 nt7.94□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 LEU2YCL018W 1095 nt7.94□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 CTI6YPL181W 1521 nt7.93□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 NAM8YHR086W 1572 nt7.93□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 YJR149WYJR149W 1215 nt7.92□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 YER152CYER152C 1332 nt7.92□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 HXT9YJL219W 1704 nt7.92□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 YMR244WYMR244W 1068 nt7.91□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.91□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.91□□□□□ -1.14
TAF3Q12297 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22 ms