Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.12□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.12□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.12□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 CYT1YOR065W 930 nt8.12□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 HEM14YER014W 1620 nt8.11□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 SAN1YDR143C 1833 nt8.11□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 MOB1YIL106W 945 nt8.11□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 FLX1YIL134W 936 nt8.11□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 IPL1YPL209C 1104 nt8.11□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 DPL1YDR294C 1770 nt8.11□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 PSD1YNL169C 1503 nt8.1□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 PHB2YGR231C 933 nt8.1□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 SBP1YHL034C 885 nt8.1□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 YCR025CYCR025C 411 nt8.09□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 SDS24YBR214W 1584 nt8.09□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 YDR467CYDR467C 327 nt8.08□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 YPT11YNL304W 1254 nt8.08□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 INH1YDL181W 258 nt8.07□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 PUP1YOR157C 786 nt8.07□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 ENO1YGR254W 1314 nt8.06□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 HXK1YFR053C 1458 nt8.06□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 GAS1YMR307W 1680 nt8.05□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 LEU4YNL104C 1860 nt8.05□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 YRF1-2YER190W 5046 nt8.05□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 HXT10YFL011W 1641 nt8.05□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 CYC3YAL039C 810 nt8.04□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 VBA3YCL069W 1377 nt8.04□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 PTC6YCR079W 1329 nt8.03□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 GGA2YHR108W 1758 nt8.03□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 GPM1YKL152C 744 nt8.03□□□□□ -1.12
RRP42Q12277 YHR218WYHR218W 1812 nt8.01□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 LYS20YDL182W 1287 nt8.01□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 RSM7YJR113C 744 nt8.01□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 SRP102YKL154W 735 nt8□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 ALD5YER073W 1563 nt8□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.99□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.99□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 YBL095WYBL095W 813 nt7.99□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 SLG1YOR008C 1137 nt7.99□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 THI3YDL080C 1830 nt7.99□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 AGP3YFL055W 1677 nt7.98□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 YLR280CYLR280C 351 nt7.98□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.98□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 YMC2YBR104W 990 nt7.97□□□□□ -1.13
RRP42Q12277 SER2YGR208W 930 nt7.96□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 ERO1YML130C 1692 nt7.95□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 MTO1YGL236C 2010 nt7.95□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 YFR020WYFR020W 699 nt7.94□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 NPP2YEL016C 1482 nt7.94□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 HTS1YPR033C 1641 nt7.93□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 YCP4YCR004C 744 nt7.93□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 RSC4YKR008W 1878 nt7.92□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 SAM50YNL026W 1455 nt7.92□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 MRS4YKR052C 915 nt7.91□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.9□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.9□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.9□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.9□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.9□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 YLR460CYLR460C 1131 nt7.9□□□□□ -1.14
RRP42Q12277 YGR210CYGR210C 1236 nt7.89□□□□□ -1.15
RRP42Q12277 AAC3YBR085W 924 nt7.89□□□□□ -1.15
RRP42Q12277 TMS1YDR105C 1422 nt7.87□□□□□ -1.15
RRP42Q12277 AAT1YKL106W 1356 nt7.87□□□□□ -1.15
RRP42Q12277 YJL009WYJL009W 327 nt7.87□□□□□ -1.15
RRP42Q12277 FCY1YPR062W 477 nt7.87□□□□□ -1.15
RRP42Q12277 YIR035CYIR035C 765 nt7.86□□□□□ -1.15
RRP42Q12277 CHS7YHR142W 951 nt7.85□□□□□ -1.15
RRP42Q12277 TPN1YGL186C 1740 nt7.85□□□□□ -1.15
RRP42Q12277 SWM1YDR260C 513 nt7.84□□□□□ -1.15
RRP42Q12277 YJR149WYJR149W 1215 nt7.84□□□□□ -1.15
RRP42Q12277 YMR007WYMR007W 381 nt7.83□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 YMR166CYMR166C 1107 nt7.83□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 OLA1YBR025C 1185 nt7.83□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 BUB2YMR055C 921 nt7.82□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 YPL108WYPL108W 507 nt7.82□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 NBA1YOL070C 1506 nt7.82□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 RCR1YBR005W 642 nt7.81□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 FRA1YLL029W 2250 nt7.81□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 LSP1YPL004C 1026 nt7.8□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 snR86snR86 1004 nt7.79□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 MET22YOL064C 1074 nt7.79□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 ALR1YOL130W 2580 nt7.79□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 YIA6YIL006W 1122 nt7.78□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 EMC3YKL207W 762 nt7.78□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 TRP2YER090W 1524 nt7.78□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 OCH1YGL038C 1443 nt7.78□□□□□ -1.16
RRP42Q12277 THI6YPL214C 1623 nt7.77□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 TOM71YHR117W 1920 nt7.76□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 CAK1YFL029C 1107 nt7.76□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 YBR056WYBR056W 1506 nt7.76□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 MDL2YPL270W 2322 nt7.75□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 FET5YFL041W 1869 nt7.75□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 MCM5YLR274W 2328 nt7.74□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 SOD2YHR008C 702 nt7.74□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 RRT14YIL127C 621 nt7.74□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 RIB1YBL033C 1038 nt7.74□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 PDC6YGR087C 1692 nt7.73□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 RNA170RNA170 169 nt7.72□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 YOR072WYOR072W 315 nt7.72□□□□□ -1.17
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