Protein–RNA interactions for Protein: Q12151

UPC2, Sterol uptake control protein 2, yeastyeast

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPC2Q12151 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.29□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.29□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.29□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.29□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.29□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.29□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.29□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.29□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.29□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 PAU19YMR325W 375 nt8.29□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 snR31snR31 225 nt8.29□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 HXT10YFL011W 1641 nt8.29□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 FSH2YMR222C 672 nt8.28□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 KRE1YNL322C 942 nt8.28□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 PUP1YOR157C 786 nt8.28□□□□□ -1.08
UPC2Q12151 REX2YLR059C 810 nt8.27□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 LEU4YNL104C 1860 nt8.27□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 NPP1YCR026C 2229 nt8.26□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 SRP54YPR088C 1626 nt8.25□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 COG1YGL223C 1254 nt8.25□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 SDS24YBR214W 1584 nt8.25□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 THI3YDL080C 1830 nt8.24□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 YDR306CYDR306C 1437 nt8.24□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 FLX1YIL134W 936 nt8.24□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 YKR012CYKR012C 378 nt8.24□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 IPL1YPL209C 1104 nt8.24□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 VBA3YCL069W 1377 nt8.23□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 KRR1YCL059C 951 nt8.23□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 PSD1YNL169C 1503 nt8.23□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 YPL041CYPL041C 624 nt8.22□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 AGP3YFL055W 1677 nt8.21□□□□□ -1.09
UPC2Q12151 HMG2YLR450W 3138 nt8.2□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.2□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 TPO4YOR273C 1980 nt8.19□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.19□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.19□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 NAP1YKR048C 1254 nt8.19□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 MOB1YIL106W 945 nt8.18□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 BUR6YER159C 429 nt8.17□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 SBP1YHL034C 885 nt8.17□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 GPM1YKL152C 744 nt8.17□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 SLG1YOR008C 1137 nt8.17□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 PTC6YCR079W 1329 nt8.16□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 NPP2YEL016C 1482 nt8.16□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 ESBP6YNL125C 2022 nt8.16□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 FTH1YBR207W 1398 nt8.16□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 PUS7YOR243C 2031 nt8.15□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 GAS1YMR307W 1680 nt8.15□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 YDR467CYDR467C 327 nt8.15□□□□□ -1.1
UPC2Q12151 GGA2YHR108W 1758 nt8.13□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 LYS20YDL182W 1287 nt8.13□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 YCR025CYCR025C 411 nt8.12□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt8.12□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 YTH1YPR107C 627 nt8.11□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 YHL008CYHL008C 1884 nt8.11□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 ILV2YMR108W 2064 nt8.1□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 ENO1YGR254W 1314 nt8.1□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 YFR020WYFR020W 699 nt8.1□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 YPT11YNL304W 1254 nt8.1□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 FET5YFL041W 1869 nt8.09□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 SWM1YDR260C 513 nt8.09□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 CYT1YOR065W 930 nt8.09□□□□□ -1.11
UPC2Q12151 SER2YGR208W 930 nt8.08□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 CYC3YAL039C 810 nt8.08□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 SRP102YKL154W 735 nt8.07□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 YLR280CYLR280C 351 nt8.07□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 ERO1YML130C 1692 nt8.07□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 INH1YDL181W 258 nt8.06□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 YBL095WYBL095W 813 nt8.06□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 AAC3YBR085W 924 nt8.06□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.04□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.04□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.04□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.04□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.04□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 YHM2YMR241W 945 nt8.04□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 DTR1YBR180W 1719 nt8.03□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 HEM14YER014W 1620 nt8.03□□□□□ -1.12
UPC2Q12151 SAM50YNL026W 1455 nt8.02□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 MTO1YGL236C 2010 nt8.02□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 YGR210CYGR210C 1236 nt8.02□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 YLR072WYLR072W 2082 nt8.02□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 AAT1YKL106W 1356 nt8.01□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 NAS6YGR232W 687 nt8□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 FAF1YIL019W 1041 nt8□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 SRN2YLR119W 642 nt8□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 RNA170RNA170 169 nt8□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 HTS1YPR033C 1641 nt8□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 TRP2YER090W 1524 nt7.99□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 YCP4YCR004C 744 nt7.99□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 YMC2YBR104W 990 nt7.99□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 TMS1YDR105C 1422 nt7.98□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 NBA1YOL070C 1506 nt7.98□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 URA8YJR103W 1737 nt7.98□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt7.97□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 RSM7YJR113C 744 nt7.97□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 THI6YPL214C 1623 nt7.96□□□□□ -1.13
UPC2Q12151 HXT11YOL156W 1704 nt7.96□□□□□ -1.14
UPC2Q12151 MET22YOL064C 1074 nt7.96□□□□□ -1.14
UPC2Q12151 YPL108WYPL108W 507 nt7.96□□□□□ -1.14
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