Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 RFC1YOR217W 2586 nt8.79□□□□□ -1
VPS54Q12071 SDS24YBR214W 1584 nt8.78□□□□□ -1
VPS54Q12071 REX2YLR059C 810 nt8.78□□□□□ -1
VPS54Q12071 MCM5YLR274W 2328 nt8.77□□□□□ -1
VPS54Q12071 LYS20YDL182W 1287 nt8.77□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 ALD5YER073W 1563 nt8.77□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 SAM50YNL026W 1455 nt8.77□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 SRP54YPR088C 1626 nt8.76□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 RIM2YBR192W 1134 nt8.76□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 VBA3YCL069W 1377 nt8.75□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 ODC1YPL134C 933 nt8.75□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 SAN1YDR143C 1833 nt8.75□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 KGD2YDR148C 1392 nt8.74□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 YCP4YCR004C 744 nt8.74□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 CYC3YAL039C 810 nt8.74□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 CWP2YKL096W-A 279 nt8.74□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 SER2YGR208W 930 nt8.72□□□□□ -1.01
VPS54Q12071 SWM1YDR260C 513 nt8.71□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 RPC31YNL151C 756 nt8.71□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 ENO1YGR254W 1314 nt8.71□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.7□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 DPL1YDR294C 1770 nt8.69□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 DMA2YNL116W 1569 nt8.69□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 MAS1YLR163C 1389 nt8.68□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 YLR280CYLR280C 351 nt8.67□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 SRP102YKL154W 735 nt8.66□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 ERO1YML130C 1692 nt8.65□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 KRR1YCL059C 951 nt8.65□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.65□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.65□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.65□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.65□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.65□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 YIA6YIL006W 1122 nt8.65□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 RSC4YKR008W 1878 nt8.65□□□□□ -1.02
VPS54Q12071 HTS1YPR033C 1641 nt8.65□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 PTC6YCR079W 1329 nt8.64□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 SBP1YHL034C 885 nt8.64□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 RIB1YBL033C 1038 nt8.64□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 YPT11YNL304W 1254 nt8.64□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 GAS1YMR307W 1680 nt8.63□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 YGR210CYGR210C 1236 nt8.63□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 MDM35YKL053C-A 261 nt8.63□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 YFR020WYFR020W 699 nt8.62□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 SOD2YHR008C 702 nt8.62□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 ERG6YML008C 1152 nt8.62□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 YOR072WYOR072W 315 nt8.59□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 FCY1YPR062W 477 nt8.59□□□□□ -1.03
VPS54Q12071 GTB1YDR221W 2109 nt8.58□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 YMR007WYMR007W 381 nt8.58□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 THI3YDL080C 1830 nt8.58□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 LEU4YNL104C 1860 nt8.57□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 GAL2YLR081W 1725 nt8.57□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 YHR218WYHR218W 1812 nt8.57□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 RSM7YJR113C 744 nt8.55□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 GPM1YKL152C 744 nt8.55□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.55□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 YPL108WYPL108W 507 nt8.55□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 GGA2YHR108W 1758 nt8.54□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 YDR467CYDR467C 327 nt8.53□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 HXT10YFL011W 1641 nt8.53□□□□□ -1.04
VPS54Q12071 RCR1YBR005W 642 nt8.51□□□□□ -1.05
VPS54Q12071 TOK1YJL093C 2076 nt8.49□□□□□ -1.05
VPS54Q12071 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.48□□□□□ -1.05
VPS54Q12071 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.48□□□□□ -1.05
VPS54Q12071 YJL160CYJL160C 864 nt8.48□□□□□ -1.05
VPS54Q12071 LSP1YPL004C 1026 nt8.48□□□□□ -1.05
VPS54Q12071 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.47□□□□□ -1.05
VPS54Q12071 YMR166CYMR166C 1107 nt8.47□□□□□ -1.05
VPS54Q12071 YRF1-2YER190W 5046 nt8.47□□□□□ -1.05
VPS54Q12071 POP2YNR052C 1302 nt8.46□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 MEX67YPL169C 1800 nt8.45□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 PET18YCR020C 648 nt8.45□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 INH1YDL181W 258 nt8.45□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 MTO1YGL236C 2010 nt8.45□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 AGP3YFL055W 1677 nt8.45□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 NPP2YEL016C 1482 nt8.45□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 EMC3YKL207W 762 nt8.44□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 YLR460CYLR460C 1131 nt8.44□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 YBL095WYBL095W 813 nt8.44□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 MET22YOL064C 1074 nt8.44□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 YMR210WYMR210W 1350 nt8.43□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 MDL2YPL270W 2322 nt8.43□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 CAK1YFL029C 1107 nt8.42□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 AAC3YBR085W 924 nt8.42□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 YMC2YBR104W 990 nt8.42□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 OCH1YGL038C 1443 nt8.42□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 CHS7YHR142W 951 nt8.4□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 RNA170RNA170 169 nt8.4□□□□□ -1.06
VPS54Q12071 RRT14YIL127C 621 nt8.39□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 TMS1YDR105C 1422 nt8.38□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 MRS4YKR052C 915 nt8.38□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 PDC6YGR087C 1692 nt8.37□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 YJR149WYJR149W 1215 nt8.37□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 YDR306CYDR306C 1437 nt8.37□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 GRH1YDR517W 1119 nt8.36□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 YIR035CYIR035C 765 nt8.36□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 OLA1YBR025C 1185 nt8.36□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 AAT1YKL106W 1356 nt8.35□□□□□ -1.07
VPS54Q12071 UTR5YEL035C 501 nt8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.2 ms