Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 SNX3YOR357C 489 nt8.11□□□□□ -1.11
VPS68Q12016 RPD3YNL330C 1302 nt8.1□□□□□ -1.11
VPS68Q12016 YPT11YNL304W 1254 nt8.09□□□□□ -1.11
VPS68Q12016 SAN1YDR143C 1833 nt8.08□□□□□ -1.12
VPS68Q12016 BUD20YLR074C 501 nt8.07□□□□□ -1.12
VPS68Q12016 YFR020WYFR020W 699 nt8.05□□□□□ -1.12
VPS68Q12016 HIS2YFR025C 1008 nt8.05□□□□□ -1.12
VPS68Q12016 YPL108WYPL108W 507 nt8.05□□□□□ -1.12
VPS68Q12016 KGD2YDR148C 1392 nt8.05□□□□□ -1.12
VPS68Q12016 RIM2YBR192W 1134 nt8.04□□□□□ -1.12
VPS68Q12016 ZAP1YJL056C 2643 nt8.03□□□□□ -1.12
VPS68Q12016 RSM7YJR113C 744 nt8.02□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 PTC6YCR079W 1329 nt8.02□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 UGP1YKL035W 1500 nt8.01□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 GAS1YMR307W 1680 nt8.01□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 SBP1YHL034C 885 nt8□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 KRR1YCL059C 951 nt7.99□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 Q0182Q0182 405 nt7.99□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 YJL160CYJL160C 864 nt7.99□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 GRH1YDR517W 1119 nt7.98□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 CWP2YKL096W-A 279 nt7.98□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 EMC3YKL207W 762 nt7.98□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 PAU21YOR394W 495 nt7.98□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 PAU22YPL282C 495 nt7.98□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 RPC31YNL151C 756 nt7.97□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 YOR343CYOR343C 327 nt7.97□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 LSP1YPL004C 1026 nt7.97□□□□□ -1.13
VPS68Q12016 YMR166CYMR166C 1107 nt7.96□□□□□ -1.14
VPS68Q12016 YMR210WYMR210W 1350 nt7.96□□□□□ -1.14
VPS68Q12016 SSL2YIL143C 2532 nt7.95□□□□□ -1.14
VPS68Q12016 HRA1HRA1 564 nt7.95□□□□□ -1.14
VPS68Q12016 YLR460CYLR460C 1131 nt7.93□□□□□ -1.14
VPS68Q12016 ODC1YPL134C 933 nt7.92□□□□□ -1.14
VPS68Q12016 RPL12BYDR418W 498 nt7.9□□□□□ -1.14
VPS68Q12016 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.9□□□□□ -1.14
VPS68Q12016 PET18YCR020C 648 nt7.89□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 MRP1YDR347W 966 nt7.89□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 RRT14YIL127C 621 nt7.89□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 DPL1YDR294C 1770 nt7.89□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 GGA2YHR108W 1758 nt7.89□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 CAK1YFL029C 1107 nt7.88□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 CHS7YHR142W 951 nt7.88□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 OCH1YGL038C 1443 nt7.86□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 MFT1YML062C 1179 nt7.86□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.85□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 MET22YOL064C 1074 nt7.85□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 OLA1YBR025C 1185 nt7.85□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 THI3YDL080C 1830 nt7.85□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 MDM35YKL053C-A 261 nt7.84□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 GPM1YKL152C 744 nt7.84□□□□□ -1.15
VPS68Q12016 GDH1YOR375C 1365 nt7.84□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 YDR467CYDR467C 327 nt7.83□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 UTR5YEL035C 501 nt7.83□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 ADA2YDR448W 1305 nt7.82□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 YPR084WYPR084W 1371 nt7.82□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 YER156CYER156C 1017 nt7.81□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 LEU4YNL104C 1860 nt7.8□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 PDC6YGR087C 1692 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 RIM8YGL045W 1629 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 YIR035CYIR035C 765 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 RPS6AYPL090C 711 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 RPS6BYBR181C 711 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 TAD2YJL035C 753 nt7.78□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 YJR149WYJR149W 1215 nt7.78□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 YMR206WYMR206W 942 nt7.78□□□□□ -1.16
VPS68Q12016 YPT31YER031C 672 nt7.77□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 BXI1YNL305C 894 nt7.77□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 YGL114WYGL114W 2178 nt7.77□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 ELP4YPL101W 1371 nt7.76□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 RNA170RNA170 169 nt7.76□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 YBL095WYBL095W 813 nt7.76□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 YOR268CYOR268C 399 nt7.76□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 YMC2YBR104W 990 nt7.76□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 YMR209CYMR209C 1374 nt7.75□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 INH1YDL181W 258 nt7.75□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 AAC3YBR085W 924 nt7.75□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 TMS1YDR105C 1422 nt7.75□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.74□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.74□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 KAE1YKR038C 1161 nt7.74□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 DMA2YNL116W 1569 nt7.74□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 HSL7YBR133C 2484 nt7.73□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 BUB2YMR055C 921 nt7.73□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 RHO1YPR165W 630 nt7.73□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 TOS1YBR162C 1368 nt7.72□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 YJL009WYJL009W 327 nt7.72□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 TDH1YJL052W 999 nt7.72□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 MRS4YKR052C 915 nt7.72□□□□□ -1.17
VPS68Q12016 EDC2YER035W 438 nt7.71□□□□□ -1.18
VPS68Q12016 ATP2YJR121W 1536 nt7.69□□□□□ -1.18
VPS68Q12016 THI73YLR004C 1572 nt7.69□□□□□ -1.18
VPS68Q12016 ADE1YAR015W 921 nt7.69□□□□□ -1.18
VPS68Q12016 HXT10YFL011W 1641 nt7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 162.7 ms