Protein–RNA interactions for Protein: P57086

SCAND1, SCAN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAND1P57086 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAND1P57086 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAND1P57086 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAND1P57086 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms