Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 SAM50YNL026W 1455 nt10.43□□□□□ -0.74
HEF3P53978 LEU4YNL104C 1860 nt10.43□□□□□ -0.74
HEF3P53978 PTC6YCR079W 1329 nt10.42□□□□□ -0.74
HEF3P53978 ENO1YGR254W 1314 nt10.41□□□□□ -0.74
HEF3P53978 SER2YGR208W 930 nt10.4□□□□□ -0.74
HEF3P53978 SBP1YHL034C 885 nt10.4□□□□□ -0.74
HEF3P53978 CYC3YAL039C 810 nt10.4□□□□□ -0.74
HEF3P53978 YLR280CYLR280C 351 nt10.4□□□□□ -0.74
HEF3P53978 HXT10YFL011W 1641 nt10.4□□□□□ -0.75
HEF3P53978 GAS1YMR307W 1680 nt10.39□□□□□ -0.75
HEF3P53978 THI3YDL080C 1830 nt10.38□□□□□ -0.75
HEF3P53978 YDR467CYDR467C 327 nt10.37□□□□□ -0.75
HEF3P53978 ERO1YML130C 1692 nt10.36□□□□□ -0.75
HEF3P53978 HEL2YDR266C 1920 nt10.35□□□□□ -0.75
HEF3P53978 PSD1YNL169C 1503 nt10.34□□□□□ -0.75
HEF3P53978 SWM1YDR260C 513 nt10.34□□□□□ -0.75
HEF3P53978 GPM1YKL152C 744 nt10.34□□□□□ -0.75
HEF3P53978 FCY1YPR062W 477 nt10.34□□□□□ -0.75
HEF3P53978 YCP4YCR004C 744 nt10.32□□□□□ -0.76
HEF3P53978 KRR1YCL059C 951 nt10.31□□□□□ -0.76
HEF3P53978 YFR020WYFR020W 699 nt10.31□□□□□ -0.76
HEF3P53978 YGR210CYGR210C 1236 nt10.31□□□□□ -0.76
HEF3P53978 SRP102YKL154W 735 nt10.31□□□□□ -0.76
HEF3P53978 YPT11YNL304W 1254 nt10.31□□□□□ -0.76
HEF3P53978 GGA2YHR108W 1758 nt10.3□□□□□ -0.76
HEF3P53978 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt10.3□□□□□ -0.76
HEF3P53978 YHR218WYHR218W 1812 nt10.29□□□□□ -0.76
HEF3P53978 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt10.29□□□□□ -0.76
HEF3P53978 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt10.29□□□□□ -0.76
HEF3P53978 NPP2YEL016C 1482 nt10.29□□□□□ -0.76
HEF3P53978 HTS1YPR033C 1641 nt10.29□□□□□ -0.76
HEF3P53978 AGP3YFL055W 1677 nt10.27□□□□□ -0.77
HEF3P53978 RSM7YJR113C 744 nt10.23□□□□□ -0.77
HEF3P53978 YBL095WYBL095W 813 nt10.22□□□□□ -0.77
HEF3P53978 SOD2YHR008C 702 nt10.2□□□□□ -0.78
HEF3P53978 CYT1YOR065W 930 nt10.2□□□□□ -0.78
HEF3P53978 YPL108WYPL108W 507 nt10.2□□□□□ -0.78
HEF3P53978 YMC2YBR104W 990 nt10.2□□□□□ -0.78
HEF3P53978 INH1YDL181W 258 nt10.19□□□□□ -0.78
HEF3P53978 ERG6YML008C 1152 nt10.19□□□□□ -0.78
HEF3P53978 PET18YCR020C 648 nt10.18□□□□□ -0.78
HEF3P53978 LSP1YPL004C 1026 nt10.18□□□□□ -0.78
HEF3P53978 AAT1YKL106W 1356 nt10.16□□□□□ -0.78
HEF3P53978 YIA6YIL006W 1122 nt10.16□□□□□ -0.78
HEF3P53978 RIB1YBL033C 1038 nt10.15□□□□□ -0.78
HEF3P53978 YJL160CYJL160C 864 nt10.14□□□□□ -0.79
HEF3P53978 YJR149WYJR149W 1215 nt10.14□□□□□ -0.79
HEF3P53978 YMR007WYMR007W 381 nt10.14□□□□□ -0.79
HEF3P53978 MAE1YKL029C 2010 nt10.13□□□□□ -0.79
HEF3P53978 AAC3YBR085W 924 nt10.13□□□□□ -0.79
HEF3P53978 MRS4YKR052C 915 nt10.12□□□□□ -0.79
HEF3P53978 RNA170RNA170 169 nt10.12□□□□□ -0.79
HEF3P53978 YMR166CYMR166C 1107 nt10.12□□□□□ -0.79
HEF3P53978 MET22YOL064C 1074 nt10.12□□□□□ -0.79
HEF3P53978 MTO1YGL236C 2010 nt10.12□□□□□ -0.79
HEF3P53978 MEP1YGR121C 1479 nt10.11□□□□□ -0.79
HEF3P53978 CAK1YFL029C 1107 nt10.1□□□□□ -0.79
HEF3P53978 OCH1YGL038C 1443 nt10.08□□□□□ -0.8
HEF3P53978 TRP2YER090W 1524 nt10.08□□□□□ -0.8
HEF3P53978 TPN1YGL186C 1740 nt10.08□□□□□ -0.8
HEF3P53978 YJL009WYJL009W 327 nt10.08□□□□□ -0.8
HEF3P53978 EMC3YKL207W 762 nt10.08□□□□□ -0.8
HEF3P53978 YLR460CYLR460C 1131 nt10.08□□□□□ -0.8
HEF3P53978 YMR210WYMR210W 1350 nt10.08□□□□□ -0.8
HEF3P53978 TMS1YDR105C 1422 nt10.07□□□□□ -0.8
HEF3P53978 FET5YFL041W 1869 nt10.07□□□□□ -0.8
HEF3P53978 UTR5YEL035C 501 nt10.07□□□□□ -0.8
HEF3P53978 snR86snR86 1004 nt10.06□□□□□ -0.8
HEF3P53978 CHS7YHR142W 951 nt10.03□□□□□ -0.8
HEF3P53978 THI6YPL214C 1623 nt10.03□□□□□ -0.8
HEF3P53978 YBR056WYBR056W 1506 nt10.02□□□□□ -0.8
HEF3P53978 RCR1YBR005W 642 nt10.02□□□□□ -0.81
HEF3P53978 RPS6AYPL090C 711 nt10.02□□□□□ -0.81
HEF3P53978 RPS6BYBR181C 711 nt10.02□□□□□ -0.81
HEF3P53978 PDC6YGR087C 1692 nt10.02□□□□□ -0.81
HEF3P53978 SHC1YER096W 1539 nt10.02□□□□□ -0.81
HEF3P53978 BUB2YMR055C 921 nt10.01□□□□□ -0.81
HEF3P53978 YER152W-AYER152W-A 567 nt10□□□□□ -0.81
HEF3P53978 BXI1YNL305C 894 nt10□□□□□ -0.81
HEF3P53978 OLA1YBR025C 1185 nt10□□□□□ -0.81
HEF3P53978 TPO4YOR273C 1980 nt10□□□□□ -0.81
HEF3P53978 RHO1YPR165W 630 nt9.99□□□□□ -0.81
HEF3P53978 YIR035CYIR035C 765 nt9.98□□□□□ -0.81
HEF3P53978 RRT14YIL127C 621 nt9.97□□□□□ -0.81
HEF3P53978 THI73YLR004C 1572 nt9.97□□□□□ -0.81
HEF3P53978 POP2YNR052C 1302 nt9.96□□□□□ -0.82
HEF3P53978 HXT11YOL156W 1704 nt9.96□□□□□ -0.82
HEF3P53978 SRM1YGL097W 1449 nt9.95□□□□□ -0.82
HEF3P53978 NBA1YOL070C 1506 nt9.95□□□□□ -0.82
HEF3P53978 YLR072WYLR072W 2082 nt9.94□□□□□ -0.82
HEF3P53978 GRH1YDR517W 1119 nt9.94□□□□□ -0.82
HEF3P53978 YHL008CYHL008C 1884 nt9.91□□□□□ -0.82
HEF3P53978 LRO1YNR008W 1986 nt9.91□□□□□ -0.82
HEF3P53978 ABP1YCR088W 1779 nt9.91□□□□□ -0.82
HEF3P53978 YER156CYER156C 1017 nt9.9□□□□□ -0.82
HEF3P53978 PAU21YOR394W 495 nt9.89□□□□□ -0.83
HEF3P53978 PAU22YPL282C 495 nt9.89□□□□□ -0.83
HEF3P53978 ADA2YDR448W 1305 nt9.88□□□□□ -0.83
HEF3P53978 YPT31YER031C 672 nt9.88□□□□□ -0.83
HEF3P53978 INO1YJL153C 1602 nt9.88□□□□□ -0.83
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