Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.12□□□□□ -1.27
AVT5P38176 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.12□□□□□ -1.27
AVT5P38176 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.12□□□□□ -1.27
AVT5P38176 TPS1YBR126C 1488 nt7.12□□□□□ -1.27
AVT5P38176 YDR455CYDR455C 309 nt7.12□□□□□ -1.27
AVT5P38176 MCM5YLR274W 2328 nt7.12□□□□□ -1.27
AVT5P38176 YPL264CYPL264C 1062 nt7.11□□□□□ -1.27
AVT5P38176 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.11□□□□□ -1.27
AVT5P38176 YMR253CYMR253C 1245 nt7.1□□□□□ -1.27
AVT5P38176 AAT1YKL106W 1356 nt7.09□□□□□ -1.27
AVT5P38176 RIB2YOL066C 1776 nt7.09□□□□□ -1.27
AVT5P38176 YMR210WYMR210W 1350 nt7.08□□□□□ -1.28
AVT5P38176 GAL3YDR009W 1563 nt7.08□□□□□ -1.28
AVT5P38176 ERR3YMR323W 1314 nt7.07□□□□□ -1.28
AVT5P38176 ERR1YOR393W 1314 nt7.07□□□□□ -1.28
AVT5P38176 ERR2YPL281C 1314 nt7.07□□□□□ -1.28
AVT5P38176 RSC4YKR008W 1878 nt7.07□□□□□ -1.28
AVT5P38176 TMA23YMR269W 636 nt7.07□□□□□ -1.28
AVT5P38176 PMT7YDR307W 1989 nt7.06□□□□□ -1.28
AVT5P38176 ERG13YML126C 1476 nt7.06□□□□□ -1.28
AVT5P38176 DDI1YER143W 1287 nt7.06□□□□□ -1.28
AVT5P38176 ATO2YNR002C 849 nt7.06□□□□□ -1.28
AVT5P38176 RRT8YOL048C 1029 nt7.06□□□□□ -1.28
AVT5P38176 Q0010Q0010 387 nt7.06□□□□□ -1.28
AVT5P38176 YIL108WYIL108W 2091 nt7.05□□□□□ -1.28
AVT5P38176 YNR029CYNR029C 1290 nt7.05□□□□□ -1.28
AVT5P38176 YBL095WYBL095W 813 nt7.04□□□□□ -1.28
AVT5P38176 YNL040WYNL040W 1371 nt7.04□□□□□ -1.28
AVT5P38176 IMO32YGR031W 1029 nt7.03□□□□□ -1.28
AVT5P38176 ADH1YOL086C 1047 nt7.03□□□□□ -1.28
AVT5P38176 MAS2YHR024C 1449 nt7.01□□□□□ -1.29
AVT5P38176 SAC7YDR389W 1965 nt7.01□□□□□ -1.29
AVT5P38176 YMC2YBR104W 990 nt7.01□□□□□ -1.29
AVT5P38176 AQR1YNL065W 1761 nt6.99□□□□□ -1.29
AVT5P38176 YER152CYER152C 1332 nt6.99□□□□□ -1.29
AVT5P38176 CCR4YAL021C 2514 nt6.97□□□□□ -1.29
AVT5P38176 ADE8YDR408C 645 nt6.97□□□□□ -1.29
AVT5P38176 YJR114WYJR114W 393 nt6.97□□□□□ -1.29
AVT5P38176 YJR154WYJR154W 1041 nt6.97□□□□□ -1.29
AVT5P38176 GPM1YKL152C 744 nt6.97□□□□□ -1.29
AVT5P38176 AFG2YLR397C 2343 nt6.97□□□□□ -1.29
AVT5P38176 LEA1YPL213W 717 nt6.97□□□□□ -1.29
AVT5P38176 HXT13YEL069C 1695 nt6.96□□□□□ -1.29
AVT5P38176 YDR306CYDR306C 1437 nt6.96□□□□□ -1.3
AVT5P38176 YNR064CYNR064C 873 nt6.96□□□□□ -1.3
AVT5P38176 MAM3YOL060C 2121 nt6.96□□□□□ -1.3
AVT5P38176 SAM50YNL026W 1455 nt6.96□□□□□ -1.3
AVT5P38176 POB3YML069W 1659 nt6.96□□□□□ -1.3
AVT5P38176 HXT9YJL219W 1704 nt6.96□□□□□ -1.3
AVT5P38176 ADE2YOR128C 1716 nt6.96□□□□□ -1.3
AVT5P38176 CCT5YJR064W 1689 nt6.95□□□□□ -1.3
AVT5P38176 YLR072WYLR072W 2082 nt6.94□□□□□ -1.3
AVT5P38176 RPN14YGL004C 1254 nt6.94□□□□□ -1.3
AVT5P38176 YMR265CYMR265C 1386 nt6.94□□□□□ -1.3
AVT5P38176 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.93□□□□□ -1.3
AVT5P38176 YPR126CYPR126C 309 nt6.93□□□□□ -1.3
AVT5P38176 IML3YBR107C 738 nt6.93□□□□□ -1.3
AVT5P38176 KEL3YPL263C 1956 nt6.93□□□□□ -1.3
AVT5P38176 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.92□□□□□ -1.3
AVT5P38176 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.92□□□□□ -1.3
AVT5P38176 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.92□□□□□ -1.3
AVT5P38176 MSB3YNL293W 1902 nt6.92□□□□□ -1.3
AVT5P38176 TVP23YDR084C 600 nt6.92□□□□□ -1.3
AVT5P38176 YJL195CYJL195C 702 nt6.92□□□□□ -1.3
AVT5P38176 ELO1YJL196C 933 nt6.92□□□□□ -1.3
AVT5P38176 HAP5YOR358W 729 nt6.91□□□□□ -1.3
AVT5P38176 YIL177CYIL177C 5277 nt6.91□□□□□ -1.3
AVT5P38176 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt6.9□□□□□ -1.3
AVT5P38176 RRT6YGL146C 936 nt6.9□□□□□ -1.3
AVT5P38176 OPI3YJR073C 621 nt6.9□□□□□ -1.3
AVT5P38176 SNZ1YMR096W 894 nt6.9□□□□□ -1.3
AVT5P38176 SUV3YPL029W 2214 nt6.89□□□□□ -1.31
AVT5P38176 SPS100YHR139C 981 nt6.89□□□□□ -1.31
AVT5P38176 snR31snR31 225 nt6.89□□□□□ -1.31
AVT5P38176 WSC4YHL028W 1818 nt6.87□□□□□ -1.31
AVT5P38176 CTI6YPL181W 1521 nt6.87□□□□□ -1.31
AVT5P38176 PUS7YOR243C 2031 nt6.86□□□□□ -1.31
AVT5P38176 FUN14YAL008W 597 nt6.86□□□□□ -1.31
AVT5P38176 ESS1YJR017C 513 nt6.86□□□□□ -1.31
AVT5P38176 ABP1YCR088W 1779 nt6.85□□□□□ -1.31
AVT5P38176 YEL008WYEL008W 381 nt6.85□□□□□ -1.31
AVT5P38176 MRS4YKR052C 915 nt6.85□□□□□ -1.31
AVT5P38176 MHF1YOL086W-A 273 nt6.85□□□□□ -1.31
AVT5P38176 FCP1YMR277W 2199 nt6.85□□□□□ -1.31
AVT5P38176 YER137CYER137C 447 nt6.84□□□□□ -1.31
AVT5P38176 APS2YJR058C 444 nt6.84□□□□□ -1.31
AVT5P38176 SNU66YOR308C 1764 nt6.84□□□□□ -1.31
AVT5P38176 TAF13YML098W 504 nt6.83□□□□□ -1.32
AVT5P38176 ABZ2YMR289W 1125 nt6.83□□□□□ -1.32
AVT5P38176 AMF1YOR378W 1548 nt6.82□□□□□ -1.32
AVT5P38176 snR86snR86 1004 nt6.82□□□□□ -1.32
AVT5P38176 YGR139WYGR139W 339 nt6.82□□□□□ -1.32
AVT5P38176 APT1YML022W 564 nt6.82□□□□□ -1.32
AVT5P38176 SWT21YNL187W 1074 nt6.82□□□□□ -1.32
AVT5P38176 YBL111CYBL111C 2004 nt6.82□□□□□ -1.32
AVT5P38176 NDE2YDL085W 1638 nt6.82□□□□□ -1.32
AVT5P38176 ENO2YHR174W 1314 nt6.81□□□□□ -1.32
AVT5P38176 CRC1YOR100C 984 nt6.81□□□□□ -1.32
AVT5P38176 THI3YDL080C 1830 nt6.8□□□□□ -1.32
AVT5P38176 BNA3YJL060W 1335 nt6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.1 ms