Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp31E9Q6Y8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp31E9Q6Y8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp31E9Q6Y8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp31E9Q6Y8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp31E9Q6Y8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp31E9Q6Y8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp31E9Q6Y8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp31E9Q6Y8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp31E9Q6Y8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp31E9Q6Y8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp31E9Q6Y8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp31E9Q6Y8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp31E9Q6Y8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp31E9Q6Y8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp31E9Q6Y8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp31E9Q6Y8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp31E9Q6Y8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp31E9Q6Y8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp31E9Q6Y8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp31E9Q6Y8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp31E9Q6Y8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp31E9Q6Y8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp31E9Q6Y8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Usp31E9Q6Y8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp31E9Q6Y8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp31E9Q6Y8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp31E9Q6Y8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp31E9Q6Y8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp31E9Q6Y8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp31E9Q6Y8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp31E9Q6Y8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp31E9Q6Y8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp31E9Q6Y8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp31E9Q6Y8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp31E9Q6Y8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp31E9Q6Y8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp31E9Q6Y8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Usp31E9Q6Y8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp31E9Q6Y8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp31E9Q6Y8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp31E9Q6Y8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp31E9Q6Y8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp31E9Q6Y8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp31E9Q6Y8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp31E9Q6Y8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms