Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
Usp31E9Q6Y8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Usp31E9Q6Y8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Usp31E9Q6Y8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
Usp31E9Q6Y8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Usp31E9Q6Y8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Usp31E9Q6Y8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Usp31E9Q6Y8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Usp31E9Q6Y8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Usp31E9Q6Y8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Usp31E9Q6Y8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Usp31E9Q6Y8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Usp31E9Q6Y8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Usp31E9Q6Y8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Usp31E9Q6Y8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Usp31E9Q6Y8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Usp31E9Q6Y8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Usp31E9Q6Y8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Usp31E9Q6Y8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Usp31E9Q6Y8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Usp31E9Q6Y8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Usp31E9Q6Y8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Usp31E9Q6Y8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Usp31E9Q6Y8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Usp31E9Q6Y8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Usp31E9Q6Y8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Usp31E9Q6Y8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Usp31E9Q6Y8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Usp31E9Q6Y8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Usp31E9Q6Y8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Usp31E9Q6Y8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Usp31E9Q6Y8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Usp31E9Q6Y8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.63■■■■□ 3.3
Usp31E9Q6Y8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Usp31E9Q6Y8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Usp31E9Q6Y8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Usp31E9Q6Y8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
Usp31E9Q6Y8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Usp31E9Q6Y8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Usp31E9Q6Y8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Usp31E9Q6Y8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Usp31E9Q6Y8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Usp31E9Q6Y8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Usp31E9Q6Y8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Usp31E9Q6Y8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Usp31E9Q6Y8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Usp31E9Q6Y8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Usp31E9Q6Y8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Usp31E9Q6Y8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Usp31E9Q6Y8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Usp31E9Q6Y8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Usp31E9Q6Y8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Usp31E9Q6Y8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Usp31E9Q6Y8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Usp31E9Q6Y8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Usp31E9Q6Y8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Usp31E9Q6Y8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Usp31E9Q6Y8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Usp31E9Q6Y8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Usp31E9Q6Y8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Usp31E9Q6Y8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Usp31E9Q6Y8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Usp31E9Q6Y8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Usp31E9Q6Y8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Usp31E9Q6Y8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Usp31E9Q6Y8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Usp31E9Q6Y8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Usp31E9Q6Y8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Usp31E9Q6Y8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Usp31E9Q6Y8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Usp31E9Q6Y8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Usp31E9Q6Y8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Usp31E9Q6Y8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Usp31E9Q6Y8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Usp31E9Q6Y8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Usp31E9Q6Y8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Usp31E9Q6Y8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
Usp31E9Q6Y8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Usp31E9Q6Y8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Usp31E9Q6Y8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Usp31E9Q6Y8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Usp31E9Q6Y8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Usp31E9Q6Y8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Usp31E9Q6Y8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Usp31E9Q6Y8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Usp31E9Q6Y8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Usp31E9Q6Y8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Usp31E9Q6Y8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Usp31E9Q6Y8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp31E9Q6Y8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp31E9Q6Y8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp31E9Q6Y8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp31E9Q6Y8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Usp31E9Q6Y8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Usp31E9Q6Y8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Usp31E9Q6Y8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Usp31E9Q6Y8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Usp31E9Q6Y8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Usp31E9Q6Y8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms