Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scml2B1AVB3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scml2B1AVB3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Scml2B1AVB3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Scml2B1AVB3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scml2B1AVB3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scml2B1AVB3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scml2B1AVB3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scml2B1AVB3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scml2B1AVB3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Scml2B1AVB3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scml2B1AVB3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scml2B1AVB3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scml2B1AVB3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scml2B1AVB3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scml2B1AVB3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms