Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms