Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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EXT1Q16394 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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EXT1Q16394 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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EXT1Q16394 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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EXT1Q16394 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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EXT1Q16394 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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EXT1Q16394 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT1Q16394 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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