Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

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Length 1,178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.51□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.51□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 YBR178WYBR178W 375 nt1.51□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 SEC21YNL287W 2808 nt1.51□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 CLU1YMR012W 3834 nt1.5□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 EST2YLR318W 2655 nt1.5□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 ASE1YOR058C 2658 nt1.5□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 APL3YBL037W 3078 nt1.5□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.5□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 YML002WYML002W 2214 nt1.5□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.49□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.49□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.49□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.49□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.49□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.49□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.49□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 SPC110YDR356W 2835 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 LAA1YJL207C 6045 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 AZF1YOR113W 2745 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 FYV10YIL097W 1551 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 SXM1YDR395W 2835 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 TFB5YDR079C-A 219 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 SOM1YEL059C-A 225 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 NUP145YGL092W 3954 nt1.48□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.47□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.47□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 snR190snR190 190 nt1.47□□□□□ -2.17
ATG11Q12527 MSN5YDR335W 3675 nt1.46□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 PET127YOR017W 2403 nt1.46□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 ROM2YLR371W 4071 nt1.46□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 YDR544CYDR544C 429 nt1.46□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 PIK1YNL267W 3201 nt1.45□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 CDC25YLR310C 4770 nt1.44□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 FYV8YGR196C 2454 nt1.44□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 CDC39YCR093W 6327 nt1.43□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 IML1YJR138W 4755 nt1.43□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 YLR041WYLR041W 321 nt1.43□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.43□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 RPL26BYGR034W 384 nt1.42□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.41□□□□□ -2.18
ATG11Q12527 MYO1YHR023W 5787 nt1.4□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 YLR232WYLR232W 348 nt1.4□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 HKR1YDR420W 5409 nt1.4□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.39□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 SEC3YER008C 4011 nt1.39□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 YMR326CYMR326C 309 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 RAD9YDR217C 3930 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 snR61snR61 90 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 COG6YNL041C 2520 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 RCO1YMR075W 2055 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 YDR210WYDR210W 228 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG11Q12527 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.33□□□□□ -2.2
ATG11Q12527 BUD3YCL014W 4911 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG11Q12527 YHR217CYHR217C 462 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG11Q12527 SIP4YJL089W 2490 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG11Q12527 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG11Q12527 SEC1YDR164C 2175 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG11Q12527 KAP120YPL125W 3099 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG11Q12527 PAU12YGR294W 363 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG11Q12527 PAU24YBR301W 363 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG11Q12527 PRP16YKR086W 3216 nt1.28□□□□□ -2.2
ATG11Q12527 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.28□□□□□ -2.2
ATG11Q12527 SEC8YPR055W 3198 nt1.27□□□□□ -2.21
ATG11Q12527 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.26□□□□□ -2.21
ATG11Q12527 YJR029WYJR029W 5268 nt1.24□□□□□ -2.21
ATG11Q12527 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.24□□□□□ -2.21
ATG11Q12527 YDL073WYDL073W 2955 nt1.22□□□□□ -2.21
ATG11Q12527 SPT7YBR081C 3999 nt1.22□□□□□ -2.21
ATG11Q12527 BIR1YJR089W 2865 nt1.21□□□□□ -2.22
ATG11Q12527 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.21□□□□□ -2.22
ATG11Q12527 BEM3YPL115C 3387 nt1.21□□□□□ -2.22
ATG11Q12527 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.2□□□□□ -2.22
ATG11Q12527 UBP3YER151C 2739 nt1.18□□□□□ -2.22
ATG11Q12527 YNL266WYNL266W 420 nt1.18□□□□□ -2.22
ATG11Q12527 RKR1YMR247C 4689 nt1.17□□□□□ -2.22
ATG11Q12527 SBH1YER087C-B 249 nt1.16□□□□□ -2.22
ATG11Q12527 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.15□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 NST1YNL091W 3723 nt1.14□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 NNF2YGR089W 2811 nt1.14□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 snR81snR81 201 nt1.13□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1.13□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 YSP1YHR155W 3687 nt1.12□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 VAM6YDL077C 3150 nt1.12□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG11Q12527 BEM2YER155C 6504 nt1.07□□□□□ -2.24
ATG11Q12527 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt1.07□□□□□ -2.24
ATG11Q12527 GLG1YKR058W 1851 nt1.07□□□□□ -2.24
ATG11Q12527 DOP1YDR141C 5097 nt1.05□□□□□ -2.24
ATG11Q12527 SCC2YDR180W 4482 nt1.04□□□□□ -2.24
ATG11Q12527 ULP2YIL031W 3105 nt1.04□□□□□ -2.24
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