Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 SMC1YFL008W 3678 nt1.26□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 ASE1YOR058C 2658 nt1.26□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 APL3YBL037W 3078 nt1.25□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 COX5BYIL111W 456 nt1.25□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 SWI4YER111C 3282 nt1.25□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 NOP9YJL010C 2001 nt1.25□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 CHS6YJL099W 2241 nt1.24□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 WAR1YML076C 2835 nt1.24□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 YLL020CYLL020C 306 nt1.24□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 UTP8YGR128C 2142 nt1.24□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 CDC39YCR093W 6327 nt1.24□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 RAD9YDR217C 3930 nt1.22□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 TAH1YCR060W 336 nt1.22□□□□□ -2.21
UBX3Q12229 snR39BsnR39B 96 nt1.21□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.2□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 NUP145YGL092W 3954 nt1.2□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 YML002WYML002W 2214 nt1.19□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.19□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 OST4YDL232W 111 nt1.19□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 FYV10YIL097W 1551 nt1.19□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 snR190snR190 190 nt1.19□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 MYO1YHR023W 5787 nt1.18□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 QCR9YGR183C 201 nt1.18□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 YBR099CYBR099C 384 nt1.18□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 MSH3YCR092C 3057 nt1.18□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 YLR041WYLR041W 321 nt1.17□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.17□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 YBL109WYBL109W 336 nt1.17□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.17□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 YDR544CYDR544C 429 nt1.16□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.16□□□□□ -2.22
UBX3Q12229 PMP2YEL017C-A 132 nt1.15□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 RPL26BYGR034W 384 nt1.15□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 LAA1YJL207C 6045 nt1.14□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 SOM1YEL059C-A 225 nt1.14□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.13□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.12□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 BUD3YCL014W 4911 nt1.11□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt1.11□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 YLR232WYLR232W 348 nt1.11□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 NST1YNL091W 3723 nt1.1□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 ROM2YLR371W 4071 nt1.1□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 COG6YNL041C 2520 nt1.1□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 SIP4YJL089W 2490 nt1.09□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 TFB5YDR079C-A 219 nt1.09□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.09□□□□□ -2.23
UBX3Q12229 YGR130CYGR130C 2451 nt1.09□□□□□ -2.24
UBX3Q12229 YDR210WYDR210W 228 nt1.08□□□□□ -2.24
UBX3Q12229 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.08□□□□□ -2.24
UBX3Q12229 YBR178WYBR178W 375 nt1.07□□□□□ -2.24
UBX3Q12229 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.06□□□□□ -2.24
UBX3Q12229 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.06□□□□□ -2.24
UBX3Q12229 RCO1YMR075W 2055 nt1.06□□□□□ -2.24
UBX3Q12229 SEC1YDR164C 2175 nt1.05□□□□□ -2.24
UBX3Q12229 KAP120YPL125W 3099 nt1.05□□□□□ -2.24
UBX3Q12229 BEM2YER155C 6504 nt1.04□□□□□ -2.24
UBX3Q12229 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.03□□□□□ -2.24
UBX3Q12229 IML1YJR138W 4755 nt1.03□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 SEC8YPR055W 3198 nt1.02□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.02□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 PRP16YKR086W 3216 nt1.01□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 snR61snR61 90 nt1.01□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 SPT7YBR081C 3999 nt1.01□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 VAM6YDL077C 3150 nt1□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.99□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 RKR1YMR247C 4689 nt0.98□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 YMR326CYMR326C 309 nt0.98□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 YDL073WYDL073W 2955 nt0.98□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 YJR029WYJR029W 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
UBX3Q12229 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.96□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 STF2YGR008C 255 nt0.96□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.95□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.95□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 YHR217CYHR217C 462 nt0.95□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 BEM3YPL115C 3387 nt0.94□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 BIR1YJR089W 2865 nt0.94□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.94□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 UBP3YER151C 2739 nt0.94□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 SCC2YDR180W 4482 nt0.93□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 NNF2YGR089W 2811 nt0.93□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 YNL266WYNL266W 420 nt0.92□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.92□□□□□ -2.26
UBX3Q12229 YSP1YHR155W 3687 nt0.9□□□□□ -2.27
UBX3Q12229 PAU24YBR301W 363 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX3Q12229 DOP1YDR141C 5097 nt0.89□□□□□ -2.27
UBX3Q12229 snR81snR81 201 nt0.85□□□□□ -2.27
UBX3Q12229 SBH1YER087C-B 249 nt0.85□□□□□ -2.27
UBX3Q12229 GLG1YKR058W 1851 nt0.85□□□□□ -2.27
UBX3Q12229 YPR117WYPR117W 7470 nt0.85□□□□□ -2.27
UBX3Q12229 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.84□□□□□ -2.28
UBX3Q12229 ULP2YIL031W 3105 nt0.83□□□□□ -2.28
UBX3Q12229 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.82□□□□□ -2.28
UBX3Q12229 HUG1YML058W-A 207 nt0.82□□□□□ -2.28
UBX3Q12229 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.79□□□□□ -2.28
UBX3Q12229 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.79□□□□□ -2.28
UBX3Q12229 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.8 ms