Protein–RNA interactions for Protein: Q12116

TMS1, Membrane protein TMS1, yeastyeast

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMS1Q12116 SPT7YBR081C 3999 nt1□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 NOP9YJL010C 2001 nt1□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 NUP157YER105C 4176 nt1□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 BEM2YER155C 6504 nt1□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 YPL044CYPL044C 549 nt0.99□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 DOP1YDR141C 5097 nt0.98□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 BUD3YCL014W 4911 nt0.98□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.98□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.98□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 HAL9YOL089C 3093 nt0.97□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 UTP8YGR128C 2142 nt0.97□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.97□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 RPL26BYGR034W 384 nt0.97□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.97□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.96□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 YLR282CYLR282C 342 nt0.96□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.96□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 PRP5YBR237W 2550 nt0.95□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 VAM6YDL077C 3150 nt0.95□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 PRP42YDR235W 1635 nt0.94□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 COX5BYIL111W 456 nt0.94□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 YML002WYML002W 2214 nt0.93□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 snR190snR190 190 nt0.93□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 KAP120YPL125W 3099 nt0.92□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 YOL014WYOL014W 375 nt0.91□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 SCC2YDR180W 4482 nt0.91□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 YDL073WYDL073W 2955 nt0.9□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 BFR2YDR299W 1605 nt0.9□□□□□ -2.26
TMS1Q12116 FYV10YIL097W 1551 nt0.9□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.89□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 PRP16YKR086W 3216 nt0.89□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.88□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 YPR117WYPR117W 7470 nt0.86□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 ASE1YOR058C 2658 nt0.86□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 SEC8YPR055W 3198 nt0.86□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 YJR029WYJR029W 5268 nt0.85□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.85□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 TAH1YCR060W 336 nt0.85□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.85□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 YGL182CYGL182C 324 nt0.85□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 YBL053WYBL053W 375 nt0.85□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 YOR102WYOR102W 351 nt0.85□□□□□ -2.27
TMS1Q12116 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.83□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 YMR160WYMR160W 2451 nt0.83□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 YLR232WYLR232W 348 nt0.82□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 BEM3YPL115C 3387 nt0.82□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 YLR041WYLR041W 321 nt0.81□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.81□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 YDR544CYDR544C 429 nt0.8□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.8□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 CHS6YJL099W 2241 nt0.79□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.79□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 YOR170WYOR170W 306 nt0.79□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 BIR1YJR089W 2865 nt0.78□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 Q0092Q0092 141 nt0.78□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.78□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.78□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.78□□□□□ -2.28
TMS1Q12116 SNU13YEL026W 381 nt0.77□□□□□ -2.29
TMS1Q12116 snR48snR48 113 nt0.77□□□□□ -2.29
TMS1Q12116 RKR1YMR247C 4689 nt0.76□□□□□ -2.29
TMS1Q12116 ATP8Q0080 147 nt0.76□□□□□ -2.29
TMS1Q12116 YGR164WYGR164W 336 nt0.76□□□□□ -2.29
TMS1Q12116 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.75□□□□□ -2.29
TMS1Q12116 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.75□□□□□ -2.29
TMS1Q12116 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.74□□□□□ -2.29
TMS1Q12116 YNL170WYNL170W 396 nt0.74□□□□□ -2.29
TMS1Q12116 YSP1YHR155W 3687 nt0.7□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 OST4YDL232W 111 nt0.7□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.7□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 LTE1YAL024C 4308 nt0.7□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 SEC1YDR164C 2175 nt0.7□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 COG6YNL041C 2520 nt0.69□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 SDH6YDR379C-A 240 nt0.69□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 YDR210WYDR210W 228 nt0.68□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.68□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 snR39BsnR39B 96 nt0.67□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.66□□□□□ -2.3
TMS1Q12116 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.65□□□□□ -2.31
TMS1Q12116 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.64□□□□□ -2.31
TMS1Q12116 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.64□□□□□ -2.31
TMS1Q12116 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.63□□□□□ -2.31
TMS1Q12116 NNF2YGR089W 2811 nt0.63□□□□□ -2.31
TMS1Q12116 ULP2YIL031W 3105 nt0.63□□□□□ -2.31
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