Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 PRP42YDR235W 1635 nt1.28□□□□□ -2.2
HFI1Q12060 PRP5YBR237W 2550 nt1.28□□□□□ -2.2
HFI1Q12060 SPT7YBR081C 3999 nt1.26□□□□□ -2.21
HFI1Q12060 ASE1YOR058C 2658 nt1.26□□□□□ -2.21
HFI1Q12060 BFR2YDR299W 1605 nt1.26□□□□□ -2.21
HFI1Q12060 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.24□□□□□ -2.21
HFI1Q12060 SEC8YPR055W 3198 nt1.23□□□□□ -2.21
HFI1Q12060 RAD9YDR217C 3930 nt1.23□□□□□ -2.21
HFI1Q12060 FYV10YIL097W 1551 nt1.22□□□□□ -2.21
HFI1Q12060 KAP120YPL125W 3099 nt1.22□□□□□ -2.21
HFI1Q12060 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.21□□□□□ -2.22
HFI1Q12060 PRP16YKR086W 3216 nt1.19□□□□□ -2.22
HFI1Q12060 YLR041WYLR041W 321 nt1.18□□□□□ -2.22
HFI1Q12060 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.18□□□□□ -2.22
HFI1Q12060 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.16□□□□□ -2.22
HFI1Q12060 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.16□□□□□ -2.22
HFI1Q12060 YGL182CYGL182C 324 nt1.15□□□□□ -2.23
HFI1Q12060 TAH1YCR060W 336 nt1.14□□□□□ -2.23
HFI1Q12060 YLR232WYLR232W 348 nt1.12□□□□□ -2.23
HFI1Q12060 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.12□□□□□ -2.23
HFI1Q12060 NST1YNL091W 3723 nt1.11□□□□□ -2.23
HFI1Q12060 YOR102WYOR102W 351 nt1.11□□□□□ -2.23
HFI1Q12060 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.1□□□□□ -2.23
HFI1Q12060 YOR170WYOR170W 306 nt1.1□□□□□ -2.23
HFI1Q12060 BEM3YPL115C 3387 nt1.09□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.08□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 SNU13YEL026W 381 nt1.07□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 snR48snR48 113 nt1.07□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 YPR117WYPR117W 7470 nt1.06□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 YJR029WYJR029W 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.06□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 CHS6YJL099W 2241 nt1.05□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 SCC2YDR180W 4482 nt1.05□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 YBL053WYBL053W 375 nt1.05□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 UTP20YBL004W 7482 nt1.05□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 YDL073WYDL073W 2955 nt1.03□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 YDR544CYDR544C 429 nt1.03□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.03□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 RKR1YMR247C 4689 nt1.03□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 BUD3YCL014W 4911 nt1.03□□□□□ -2.24
HFI1Q12060 YSP1YHR155W 3687 nt1.03□□□□□ -2.25
HFI1Q12060 BEM2YER155C 6504 nt1.01□□□□□ -2.25
HFI1Q12060 VAM6YDL077C 3150 nt1.01□□□□□ -2.25
HFI1Q12060 OST4YDL232W 111 nt1□□□□□ -2.25
HFI1Q12060 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.99□□□□□ -2.25
HFI1Q12060 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.98□□□□□ -2.25
HFI1Q12060 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.98□□□□□ -2.25
HFI1Q12060 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.97□□□□□ -2.25
HFI1Q12060 PAU12YGR294W 363 nt0.96□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 PAU24YBR301W 363 nt0.96□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 YGR164WYGR164W 336 nt0.95□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.94□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.94□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.94□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.94□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.94□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.94□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.94□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.94□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 QCR9YGR183C 201 nt0.94□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 COG6YNL041C 2520 nt0.94□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.93□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.93□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.93□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 Q0092Q0092 141 nt0.92□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.92□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 ATP8Q0080 147 nt0.91□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 SEC1YDR164C 2175 nt0.9□□□□□ -2.26
HFI1Q12060 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.9□□□□□ -2.27
HFI1Q12060 YMR160WYMR160W 2451 nt0.9□□□□□ -2.27
HFI1Q12060 SDH6YDR379C-A 240 nt0.89□□□□□ -2.27
HFI1Q12060 DOP1YDR141C 5097 nt0.89□□□□□ -2.27
HFI1Q12060 NNF2YGR089W 2811 nt0.88□□□□□ -2.27
HFI1Q12060 YNL170WYNL170W 396 nt0.88□□□□□ -2.27
HFI1Q12060 snR39BsnR39B 96 nt0.88□□□□□ -2.27
HFI1Q12060 GLG1YKR058W 1851 nt0.88□□□□□ -2.27
HFI1Q12060 YDR210WYDR210W 228 nt0.87□□□□□ -2.27
HFI1Q12060 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.87□□□□□ -2.27
HFI1Q12060 ULP2YIL031W 3105 nt0.86□□□□□ -2.27
HFI1Q12060 RPM2YML091C 3609 nt0.84□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 LTE1YAL024C 4308 nt0.83□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.82□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 PET111YMR257C 2403 nt0.82□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.79□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.79□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.79□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.79□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.79□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.78□□□□□ -2.28
HFI1Q12060 CSE1YGL238W 2883 nt0.78□□□□□ -2.29
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