Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 YGL182CYGL182C 324 nt1.27□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 YLR282CYLR282C 342 nt1.27□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 STB6YKL072W 2301 nt1.27□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 ROM2YLR371W 4071 nt1.26□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 NUP188YML103C 4968 nt1.26□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 CLU1YMR012W 3834 nt1.25□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 COX5BYIL111W 456 nt1.25□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.25□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 APL3YBL037W 3078 nt1.25□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 RAD9YDR217C 3930 nt1.25□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 NOP9YJL010C 2001 nt1.25□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.24□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 ASE1YOR058C 2658 nt1.24□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 YPR117WYPR117W 7470 nt1.24□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 UTP8YGR128C 2142 nt1.24□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 GEA2YEL022W 4380 nt1.23□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 SMC1YFL008W 3678 nt1.23□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 YLL020CYLL020C 306 nt1.23□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 WAR1YML076C 2835 nt1.22□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 TAH1YCR060W 336 nt1.22□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.22□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 SWI4YER111C 3282 nt1.22□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 CHS6YJL099W 2241 nt1.21□□□□□ -2.21
DSE3Q08729 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.21□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 YML002WYML002W 2214 nt1.2□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 SPT7YBR081C 3999 nt1.2□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 FYV10YIL097W 1551 nt1.19□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 YLR041WYLR041W 321 nt1.19□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 snR190snR190 190 nt1.19□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 SEC3YER008C 4011 nt1.18□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 CDC39YCR093W 6327 nt1.18□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 OST4YDL232W 111 nt1.18□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 QCR9YGR183C 201 nt1.18□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 snR39BsnR39B 96 nt1.18□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.17□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.17□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.17□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 YBR099CYBR099C 384 nt1.16□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 BEM2YER155C 6504 nt1.15□□□□□ -2.22
DSE3Q08729 AZF1YOR113W 2745 nt1.15□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 RPL26BYGR034W 384 nt1.15□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.15□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 NUP145YGL092W 3954 nt1.14□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.14□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 UBP3YER151C 2739 nt1.14□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt1.13□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 YDR544CYDR544C 429 nt1.13□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 BUD3YCL014W 4911 nt1.13□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 PMP2YEL017C-A 132 nt1.12□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 SOM1YEL059C-A 225 nt1.12□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 YLR232WYLR232W 348 nt1.12□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 YBL109WYBL109W 336 nt1.12□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 VAM6YDL077C 3150 nt1.11□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 COG6YNL041C 2520 nt1.11□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 TFB5YDR079C-A 219 nt1.1□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 KAP120YPL125W 3099 nt1.09□□□□□ -2.23
DSE3Q08729 YBR178WYBR178W 375 nt1.08□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 YJR029WYJR029W 5268 nt1.08□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.08□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 DOP1YDR141C 5097 nt1.06□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.06□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.06□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 YDR210WYDR210W 228 nt1.05□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.05□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.05□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.05□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 SCC2YDR180W 4482 nt1.05□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 SEC8YPR055W 3198 nt1.05□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 PRP16YKR086W 3216 nt1.05□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 RCO1YMR075W 2055 nt1.04□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 YMR326CYMR326C 309 nt1.03□□□□□ -2.24
DSE3Q08729 SEC1YDR164C 2175 nt1.03□□□□□ -2.25
DSE3Q08729 PAU12YGR294W 363 nt1.02□□□□□ -2.25
DSE3Q08729 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.02□□□□□ -2.25
DSE3Q08729 PAU24YBR301W 363 nt1.02□□□□□ -2.25
DSE3Q08729 YDL073WYDL073W 2955 nt1.01□□□□□ -2.25
DSE3Q08729 snR61snR61 90 nt1.01□□□□□ -2.25
DSE3Q08729 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1□□□□□ -2.25
DSE3Q08729 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1□□□□□ -2.25
DSE3Q08729 UTP20YBL004W 7482 nt1□□□□□ -2.25
DSE3Q08729 MYO1YHR023W 5787 nt1□□□□□ -2.25
DSE3Q08729 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.99□□□□□ -2.25
DSE3Q08729 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.96□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 BIR1YJR089W 2865 nt0.95□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 YHR217CYHR217C 462 nt0.95□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.93□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.93□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.93□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.93□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 BEM3YPL115C 3387 nt0.93□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 RKR1YMR247C 4689 nt0.92□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.92□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 YSP1YHR155W 3687 nt0.91□□□□□ -2.26
DSE3Q08729 RPM2YML091C 3609 nt0.91□□□□□ -2.26
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