Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	snR190	snR190	190 nt		0.84	□□□□□ -2.27
MRD1	Q06106	COX12	YLR038C	252 nt		0.83	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	YDL073W	YDL073W	2955 nt		0.82	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	tT(AGU)B	tT(AGU)B	73 nt		0.82	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	tT(AGU)C	tT(AGU)C	73 nt		0.82	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	tT(AGU)D	tT(AGU)D	73 nt		0.82	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	tT(AGU)H	tT(AGU)H	73 nt		0.82	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	tT(AGU)I1	tT(AGU)I1	73 nt		0.82	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	tT(AGU)I2	tT(AGU)I2	73 nt		0.82	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	tT(AGU)J	tT(AGU)J	73 nt		0.82	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	tT(AGU)N1	tT(AGU)N1	73 nt		0.82	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	tT(AGU)N2	tT(AGU)N2	73 nt		0.82	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	tT(AGU)O1	tT(AGU)O1	73 nt		0.82	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	tT(AGU)O2	tT(AGU)O2	73 nt		0.82	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	YMR160W	YMR160W	2451 nt		0.81	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	PRP16	YKR086W	3216 nt		0.81	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	QCR9	YGR183C	201 nt		0.81	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	BLI1	YKL061W	342 nt		0.81	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	YER053C-A	YER053C-A	114 nt		0.8	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	APQ12	YIL040W	417 nt		0.8	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	YLR399W-A	YLR399W-A	105 nt		0.8	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		0.79	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	CHS6	YJL099W	2241 nt		0.79	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	COX5B	YIL111W	456 nt		0.78	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		0.78	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	YPR159C-A	YPR159C-A	102 nt		0.78	□□□□□ -2.28
MRD1	Q06106	YKL100W-A	YKL100W-A	90 nt		0.77	□□□□□ -2.29
MRD1	Q06106	YML002W	YML002W	2214 nt		0.77	□□□□□ -2.29
MRD1	Q06106	FYV10	YIL097W	1551 nt		0.76	□□□□□ -2.29
MRD1	Q06106	SPG3	YDR504C	384 nt		0.76	□□□□□ -2.29
MRD1	Q06106	JLP2	YMR132C	627 nt		0.76	□□□□□ -2.29
MRD1	Q06106	YIL002W-A	YIL002W-A	210 nt		0.75	□□□□□ -2.29
MRD1	Q06106	LTE1	YAL024C	4308 nt		0.75	□□□□□ -2.29
MRD1	Q06106	UTP20	YBL004W	7482 nt		0.75	□□□□□ -2.29
MRD1	Q06106	YEL014C	YEL014C	306 nt		0.74	□□□□□ -2.29
MRD1	Q06106	tN(GUU)Q	tN(GUU)Q	71 nt		0.74	□□□□□ -2.29
MRD1	Q06106	YKL145W-A	YKL145W-A	93 nt		0.73	□□□□□ -2.29
MRD1	Q06106	PRP5	YBR237W	2550 nt		0.71	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		0.71	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	YMR272W-A	YMR272W-A	114 nt		0.71	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	snR52	snR52	92 nt		0.71	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	HAL9	YOL089C	3093 nt		0.71	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	YOR192C-B	YOR192C-B	5313 nt		0.71	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	UTP8	YGR128C	2142 nt		0.7	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	YJL182C	YJL182C	318 nt		0.7	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	YOL014W	YOL014W	375 nt		0.7	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	YJL127W-A	YJL127W-A	117 nt		0.69	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		0.69	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	PRP42	YDR235W	1635 nt		0.68	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	OST4	YDL232W	111 nt		0.68	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	YLR041W	YLR041W	321 nt		0.66	□□□□□ -2.3
MRD1	Q06106	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		0.65	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	TRS65	YGR166W	1683 nt		0.65	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	UTP10	YJL109C	5310 nt		0.65	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		0.64	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	PRP39	YML046W	1890 nt		0.63	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	TAH1	YCR060W	336 nt		0.63	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	SNU13	YEL026W	381 nt		0.63	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	snR46	snR46	197 nt		0.63	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	BEM3	YPL115C	3387 nt		0.63	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	PET111	YMR257C	2403 nt		0.63	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	YDR544C	YDR544C	429 nt		0.61	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	YLR232W	YLR232W	348 nt		0.61	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	YSP1	YHR155W	3687 nt		0.6	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		0.6	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	YJL150W	YJL150W	303 nt		0.59	□□□□□ -2.31
MRD1	Q06106	YEL073C	YEL073C	324 nt		0.58	□□□□□ -2.32
MRD1	Q06106	YGL182C	YGL182C	324 nt		0.58	□□□□□ -2.32
MRD1	Q06106	YBL039C-A	YBL039C-A	84 nt		0.58	□□□□□ -2.32
MRD1	Q06106	NNF2	YGR089W	2811 nt		0.56	□□□□□ -2.32
MRD1	Q06106	MLP1	YKR095W	5628 nt		0.56	□□□□□ -2.32
MRD1	Q06106	ULP2	YIL031W	3105 nt		0.55	□□□□□ -2.32
MRD1	Q06106	YNL198C	YNL198C	303 nt		0.55	□□□□□ -2.32
MRD1	Q06106	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		0.54	□□□□□ -2.32
MRD1	Q06106	YOR381W-A	YOR381W-A	168 nt		0.54	□□□□□ -2.32
MRD1	Q06106	YBR072C-A	YBR072C-A	162 nt		0.54	□□□□□ -2.32
MRD1	Q06106	FMP27	YLR454W	7887 nt		0.53	□□□□□ -2.32
MRD1	Q06106	SBH1	YER087C-B	249 nt		0.51	□□□□□ -2.33
MRD1	Q06106	ORC3	YLL004W	1851 nt		0.51	□□□□□ -2.33
MRD1	Q06106	SDH6	YDR379C-A	240 nt		0.5	□□□□□ -2.33
MRD1	Q06106	YDR371C-A	YDR371C-A	105 nt		0.49	□□□□□ -2.33
MRD1	Q06106	RPS26A	YGL189C	360 nt		0.48	□□□□□ -2.33
MRD1	Q06106	AI1	Q0050	2505 nt		0.48	□□□□□ -2.33
MRD1	Q06106	COG6	YNL041C	2520 nt		0.48	□□□□□ -2.33
MRD1	Q06106	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		0.47	□□□□□ -2.33
MRD1	Q06106	NIP1	YMR309C	2439 nt		0.46	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	YNL337W	YNL337W	255 nt		0.46	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	YOR170W	YOR170W	306 nt		0.46	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	BUL2	YML111W	2763 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	YGR151C	YGR151C	336 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	IQG1	YPL242C	4488 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		0.44	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	CSE1	YGL238W	2883 nt		0.44	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		0.43	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	GLG1	YKR058W	1851 nt		0.43	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		0.42	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		0.42	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	YDR210W	YDR210W	228 nt		0.41	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	YBL053W	YBL053W	375 nt		0.41	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	MLP2	YIL149C	5040 nt		0.41	□□□□□ -2.34

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.4 ms