Protein–RNA interactions for Protein: Q04013

YHM2, Citrate/oxoglutarate carrier protein, yeastyeast

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHM2Q04013 PRP42YDR235W 1635 nt1.28□□□□□ -2.2
YHM2Q04013 YLR041WYLR041W 321 nt1.27□□□□□ -2.21
YHM2Q04013 YNL338WYNL338W 159 nt1.26□□□□□ -2.21
YHM2Q04013 NST1YNL091W 3723 nt1.26□□□□□ -2.21
YHM2Q04013 RPM2YML091C 3609 nt1.25□□□□□ -2.21
YHM2Q04013 PRP5YBR237W 2550 nt1.24□□□□□ -2.21
YHM2Q04013 SIP4YJL089W 2490 nt1.22□□□□□ -2.21
YHM2Q04013 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.22□□□□□ -2.21
YHM2Q04013 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.22□□□□□ -2.21
YHM2Q04013 UTP8YGR128C 2142 nt1.22□□□□□ -2.21
YHM2Q04013 FYV10YIL097W 1551 nt1.21□□□□□ -2.22
YHM2Q04013 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.2□□□□□ -2.22
YHM2Q04013 PET127YOR017W 2403 nt1.2□□□□□ -2.22
YHM2Q04013 QCR9YGR183C 201 nt1.19□□□□□ -2.22
YHM2Q04013 RAD9YDR217C 3930 nt1.19□□□□□ -2.22
YHM2Q04013 FYV8YGR196C 2454 nt1.18□□□□□ -2.22
YHM2Q04013 YDL073WYDL073W 2955 nt1.17□□□□□ -2.22
YHM2Q04013 YGL182CYGL182C 324 nt1.16□□□□□ -2.22
YHM2Q04013 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.15□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.15□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.15□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.15□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.15□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.15□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.15□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.15□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.15□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.13□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 YOR170WYOR170W 306 nt1.13□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 snR48snR48 113 nt1.13□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 SCC2YDR180W 4482 nt1.12□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.12□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 TAH1YCR060W 336 nt1.11□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 YLR232WYLR232W 348 nt1.11□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 SPT7YBR081C 3999 nt1.1□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.1□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 YSP1YHR155W 3687 nt1.09□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 SNU13YEL026W 381 nt1.09□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.09□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 YOR102WYOR102W 351 nt1.09□□□□□ -2.23
YHM2Q04013 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.07□□□□□ -2.24
YHM2Q04013 UBP3YER151C 2739 nt1.05□□□□□ -2.24
YHM2Q04013 LTE1YAL024C 4308 nt1.04□□□□□ -2.24
YHM2Q04013 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.04□□□□□ -2.24
YHM2Q04013 OST4YDL232W 111 nt1.04□□□□□ -2.24
YHM2Q04013 BEM3YPL115C 3387 nt1.03□□□□□ -2.24
YHM2Q04013 CHS6YJL099W 2241 nt1.03□□□□□ -2.25
YHM2Q04013 YPR117WYPR117W 7470 nt1.02□□□□□ -2.25
YHM2Q04013 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.01□□□□□ -2.25
YHM2Q04013 YBL053WYBL053W 375 nt1□□□□□ -2.25
YHM2Q04013 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.98□□□□□ -2.25
YHM2Q04013 ULP2YIL031W 3105 nt0.98□□□□□ -2.25
YHM2Q04013 YOL014WYOL014W 375 nt0.97□□□□□ -2.25
YHM2Q04013 YGR164WYGR164W 336 nt0.96□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 RKR1YMR247C 4689 nt0.95□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.95□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.94□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 COG6YNL041C 2520 nt0.94□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 YDR544CYDR544C 429 nt0.93□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.92□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.92□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 DOP1YDR141C 5097 nt0.92□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 BUD3YCL014W 4911 nt0.92□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 UTP20YBL004W 7482 nt0.91□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 ATP8Q0080 147 nt0.91□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 VAM6YDL077C 3150 nt0.91□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 GLG1YKR058W 1851 nt0.9□□□□□ -2.26
YHM2Q04013 Q0092Q0092 141 nt0.9□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.9□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 SEC1YDR164C 2175 nt0.9□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 NNF2YGR089W 2811 nt0.88□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 SDH6YDR379C-A 240 nt0.88□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 YJR029WYJR029W 5268 nt0.88□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.88□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.87□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 YNL170WYNL170W 396 nt0.87□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 BEM2YER155C 6504 nt0.87□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 IQG1YPL242C 4488 nt0.87□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.86□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.86□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 snR39BsnR39B 96 nt0.86□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 YMR160WYMR160W 2451 nt0.86□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 BUL2YML111W 2763 nt0.84□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.84□□□□□ -2.27
YHM2Q04013 YDR210WYDR210W 228 nt0.83□□□□□ -2.28
YHM2Q04013 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.82□□□□□ -2.28
YHM2Q04013 NIP1YMR309C 2439 nt0.8□□□□□ -2.28
YHM2Q04013 MLP1YKR095W 5628 nt0.8□□□□□ -2.28
YHM2Q04013 PET111YMR257C 2403 nt0.79□□□□□ -2.28
YHM2Q04013 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.76□□□□□ -2.29
YHM2Q04013 MYO1YHR023W 5787 nt0.76□□□□□ -2.29
YHM2Q04013 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.75□□□□□ -2.29
YHM2Q04013 RPS26AYGL189C 360 nt0.74□□□□□ -2.29
YHM2Q04013 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.74□□□□□ -2.29
YHM2Q04013 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.2 ms