Protein–RNA interactions for Protein: P53855

ATG2, Autophagy-related protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG2P53855 YNL303WYNL303W 348 nt-3.14□□□□□ -2.91
ATG2P53855 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-3.16□□□□□ -2.91
ATG2P53855 YKL083WYKL083W 615 nt-3.17□□□□□ -2.92
ATG2P53855 YDR220CYDR220C 294 nt-3.17□□□□□ -2.92
ATG2P53855 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-3.18□□□□□ -2.92
ATG2P53855 BUD26YDR241W 288 nt-3.19□□□□□ -2.92
ATG2P53855 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-3.19□□□□□ -2.92
ATG2P53855 YNL171CYNL171C 369 nt-3.19□□□□□ -2.92
ATG2P53855 YER090C-AYER090C-A 90 nt-3.2□□□□□ -2.92
ATG2P53855 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-3.2□□□□□ -2.92
ATG2P53855 BI2Q0110 1272 nt-3.21□□□□□ -2.92
ATG2P53855 YAF9YNL107W 681 nt-3.21□□□□□ -2.92
ATG2P53855 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-3.22□□□□□ -2.93
ATG2P53855 YFL012WYFL012W 447 nt-3.23□□□□□ -2.93
ATG2P53855 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-3.25□□□□□ -2.93
ATG2P53855 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-3.26□□□□□ -2.93
ATG2P53855 YLR202CYLR202C 327 nt-3.27□□□□□ -2.93
ATG2P53855 YPR039WYPR039W 336 nt-3.27□□□□□ -2.93
ATG2P53855 RPS30AYLR287C-A 192 nt-3.28□□□□□ -2.93
ATG2P53855 YNL266WYNL266W 420 nt-3.29□□□□□ -2.94
ATG2P53855 YML054C-AYML054C-A 159 nt-3.29□□□□□ -2.94
ATG2P53855 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-3.29□□□□□ -2.94
ATG2P53855 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-3.3□□□□□ -2.94
ATG2P53855 MRPL32YCR003W 552 nt-3.31□□□□□ -2.94
ATG2P53855 RPS27BYHR021C 249 nt-3.31□□□□□ -2.94
ATG2P53855 PRM3YPL192C 402 nt-3.33□□□□□ -2.94
ATG2P53855 YDR048CYDR048C 315 nt-3.37□□□□□ -2.95
ATG2P53855 YKL063CYKL063C 504 nt-3.37□□□□□ -2.95
ATG2P53855 snR50snR50 90 nt-3.42□□□□□ -2.96
ATG2P53855 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-3.42□□□□□ -2.96
ATG2P53855 GPI15YNL038W 690 nt-3.42□□□□□ -2.96
ATG2P53855 POP6YGR030C 477 nt-3.43□□□□□ -2.96
ATG2P53855 YDR426CYDR426C 378 nt-3.44□□□□□ -2.96
ATG2P53855 TOM22YNL131W 459 nt-3.44□□□□□ -2.96
ATG2P53855 YOR309CYOR309C 381 nt-3.44□□□□□ -2.96
ATG2P53855 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-3.47□□□□□ -2.97
ATG2P53855 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-3.47□□□□□ -2.97
ATG2P53855 YDR544CYDR544C 429 nt-3.51□□□□□ -2.97
ATG2P53855 YDL011CYDL011C 324 nt-3.51□□□□□ -2.97
ATG2P53855 IRC13YOR235W 315 nt-3.56□□□□□ -2.98
ATG2P53855 snR67snR67 82 nt-3.59□□□□□ -2.98
ATG2P53855 snR69snR69 101 nt-3.63□□□□□ -2.99
ATG2P53855 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-3.63□□□□□ -2.99
ATG2P53855 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-3.63□□□□□ -2.99
ATG2P53855 YGR069WYGR069W 336 nt-3.63□□□□□ -2.99
ATG2P53855 YLR269CYLR269C 351 nt-3.65□□□□□ -2.99
ATG2P53855 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-3.68□□□□□ -3
ATG2P53855 ATP19YOL077W-A 207 nt-3.7□□□□□ -3
ATG2P53855 YML099W-AYML099W-A 330 nt-3.72□□□□□ -3
ATG2P53855 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-3.76□□□□□ -3.01
ATG2P53855 PCC1YKR095W-A 267 nt-3.76□□□□□ -3.01
ATG2P53855 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-3.76□□□□□ -3.01
ATG2P53855 TSC3YBR058C-A 243 nt-3.77□□□□□ -3.01
ATG2P53855 YDR102CYDR102C 333 nt-3.81□□□□□ -3.02
ATG2P53855 snR57snR57 88 nt-3.82□□□□□ -3.02
ATG2P53855 YGL149WYGL149W 306 nt-3.82□□□□□ -3.02
ATG2P53855 YBL071CYBL071C 309 nt-3.82□□□□□ -3.02
ATG2P53855 YLR217WYLR217W 324 nt-3.83□□□□□ -3.02
ATG2P53855 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-3.86□□□□□ -3.03
ATG2P53855 snR9snR9 187 nt-3.87□□□□□ -3.03
ATG2P53855 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-3.88□□□□□ -3.03
ATG2P53855 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-3.91□□□□□ -3.04
ATG2P53855 HMRA1YCR097W 381 nt-3.92□□□□□ -3.04
ATG2P53855 YER137W-AYER137W-A 306 nt-3.96□□□□□ -3.04
ATG2P53855 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-3.96□□□□□ -3.04
ATG2P53855 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-3.96□□□□□ -3.04
ATG2P53855 YER175W-AYER175W-A 165 nt-3.99□□□□□ -3.05
ATG2P53855 AI5_BETAQ0075 1065 nt-4.02□□□□□ -3.05
ATG2P53855 YDL158CYDL158C 309 nt-4.04□□□□□ -3.06
ATG2P53855 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-4.05□□□□□ -3.06
ATG2P53855 YJR162CYJR162C 351 nt-4.11□□□□□ -3.07
ATG2P53855 YNL337WYNL337W 255 nt-4.11□□□□□ -3.07
ATG2P53855 YDL016CYDL016C 303 nt-4.12□□□□□ -3.07
ATG2P53855 ATG16YMR159C 453 nt-4.12□□□□□ -3.07
ATG2P53855 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-4.14□□□□□ -3.07
ATG2P53855 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-4.15□□□□□ -3.07
ATG2P53855 YER097WYER097W 330 nt-4.18□□□□□ -3.08
ATG2P53855 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-4.23□□□□□ -3.09
ATG2P53855 YAR047CYAR047C 321 nt-4.23□□□□□ -3.09
ATG2P53855 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-4.27□□□□□ -3.09
ATG2P53855 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-4.27□□□□□ -3.09
ATG2P53855 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-4.28□□□□□ -3.09
ATG2P53855 YIL029CYIL029C 429 nt-4.29□□□□□ -3.1
ATG2P53855 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-4.3□□□□□ -3.1
ATG2P53855 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-4.31□□□□□ -3.1
ATG2P53855 YPR197CYPR197C 564 nt-4.32□□□□□ -3.1
ATG2P53855 YER181CYER181C 324 nt-4.4□□□□□ -3.11
ATG2P53855 YFL032WYFL032W 321 nt-4.45□□□□□ -3.12
ATG2P53855 snR55snR55 98 nt-4.46□□□□□ -3.12
ATG2P53855 YFL019CYFL019C 354 nt-4.46□□□□□ -3.12
ATG2P53855 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-4.48□□□□□ -3.13
ATG2P53855 YBR178WYBR178W 375 nt-4.48□□□□□ -3.13
ATG2P53855 CSN9YDR179C 489 nt-4.49□□□□□ -3.13
ATG2P53855 MPC1YGL080W 393 nt-4.49□□□□□ -3.13
ATG2P53855 snR6snR6 112 nt-4.53□□□□□ -3.13
ATG2P53855 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-4.53□□□□□ -3.13
ATG2P53855 YJR157WYJR157W 363 nt-4.53□□□□□ -3.14
ATG2P53855 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-4.57□□□□□ -3.14
ATG2P53855 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-4.57□□□□□ -3.14
ATG2P53855 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-4.59□□□□□ -3.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.3 ms