Protein–RNA interactions for Protein: P53552

THO2, THO complex subunit 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THO2P53552 YCR001WYCR001W 315 nt-2.43□□□□□ -2.8
THO2P53552 YER090C-AYER090C-A 90 nt-2.44□□□□□ -2.8
THO2P53552 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-2.45□□□□□ -2.8
THO2P53552 YKL083WYKL083W 615 nt-2.46□□□□□ -2.8
THO2P53552 YNL303WYNL303W 348 nt-2.46□□□□□ -2.8
THO2P53552 BI2Q0110 1272 nt-2.47□□□□□ -2.8
THO2P53552 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-2.47□□□□□ -2.8
THO2P53552 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-2.48□□□□□ -2.81
THO2P53552 BUD26YDR241W 288 nt-2.49□□□□□ -2.81
THO2P53552 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-2.49□□□□□ -2.81
THO2P53552 YAF9YNL107W 681 nt-2.49□□□□□ -2.81
THO2P53552 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-2.49□□□□□ -2.81
THO2P53552 YFL012WYFL012W 447 nt-2.5□□□□□ -2.81
THO2P53552 YLR202CYLR202C 327 nt-2.5□□□□□ -2.81
THO2P53552 YDR220CYDR220C 294 nt-2.51□□□□□ -2.81
THO2P53552 YNL171CYNL171C 369 nt-2.51□□□□□ -2.81
THO2P53552 RPS30AYLR287C-A 192 nt-2.52□□□□□ -2.81
THO2P53552 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-2.53□□□□□ -2.81
THO2P53552 RPS27BYHR021C 249 nt-2.53□□□□□ -2.81
THO2P53552 YML054C-AYML054C-A 159 nt-2.53□□□□□ -2.81
THO2P53552 YNL266WYNL266W 420 nt-2.53□□□□□ -2.82
THO2P53552 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-2.54□□□□□ -2.82
THO2P53552 YPR039WYPR039W 336 nt-2.55□□□□□ -2.82
THO2P53552 MRPL32YCR003W 552 nt-2.56□□□□□ -2.82
THO2P53552 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-2.56□□□□□ -2.82
THO2P53552 PRM3YPL192C 402 nt-2.57□□□□□ -2.82
THO2P53552 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-2.58□□□□□ -2.82
THO2P53552 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-2.58□□□□□ -2.82
THO2P53552 YDR048CYDR048C 315 nt-2.6□□□□□ -2.83
THO2P53552 YOR309CYOR309C 381 nt-2.62□□□□□ -2.83
THO2P53552 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-2.63□□□□□ -2.83
THO2P53552 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-2.64□□□□□ -2.83
THO2P53552 GPI15YNL038W 690 nt-2.64□□□□□ -2.83
THO2P53552 snR50snR50 90 nt-2.65□□□□□ -2.83
THO2P53552 YDR426CYDR426C 378 nt-2.66□□□□□ -2.84
THO2P53552 TOM22YNL131W 459 nt-2.66□□□□□ -2.84
THO2P53552 POP6YGR030C 477 nt-2.67□□□□□ -2.84
THO2P53552 YJR162CYJR162C 351 nt-2.7□□□□□ -2.84
THO2P53552 YNL337WYNL337W 255 nt-2.7□□□□□ -2.84
THO2P53552 YDL011CYDL011C 324 nt-2.71□□□□□ -2.84
THO2P53552 YDR544CYDR544C 429 nt-2.74□□□□□ -2.85
THO2P53552 YLR269CYLR269C 351 nt-2.78□□□□□ -2.85
THO2P53552 snR67snR67 82 nt-2.78□□□□□ -2.86
THO2P53552 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-2.79□□□□□ -2.86
THO2P53552 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-2.79□□□□□ -2.86
THO2P53552 YGR069WYGR069W 336 nt-2.8□□□□□ -2.86
THO2P53552 IRC13YOR235W 315 nt-2.8□□□□□ -2.86
THO2P53552 snR69snR69 101 nt-2.81□□□□□ -2.86
THO2P53552 ATP19YOL077W-A 207 nt-2.81□□□□□ -2.86
THO2P53552 YIL029CYIL029C 429 nt-2.82□□□□□ -2.86
THO2P53552 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-2.83□□□□□ -2.86
THO2P53552 YML099W-AYML099W-A 330 nt-2.87□□□□□ -2.87
THO2P53552 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-2.89□□□□□ -2.87
THO2P53552 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-2.91□□□□□ -2.87
THO2P53552 PCC1YKR095W-A 267 nt-2.94□□□□□ -2.88
THO2P53552 YLR217WYLR217W 324 nt-2.94□□□□□ -2.88
THO2P53552 TSC3YBR058C-A 243 nt-2.94□□□□□ -2.88
THO2P53552 YGL149WYGL149W 306 nt-2.95□□□□□ -2.88
THO2P53552 YDR102CYDR102C 333 nt-2.95□□□□□ -2.88
THO2P53552 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-2.96□□□□□ -2.88
THO2P53552 YBL071CYBL071C 309 nt-2.97□□□□□ -2.89
THO2P53552 snR9snR9 187 nt-2.99□□□□□ -2.89
THO2P53552 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-3□□□□□ -2.89
THO2P53552 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-3□□□□□ -2.89
THO2P53552 HMRA1YCR097W 381 nt-3.02□□□□□ -2.89
THO2P53552 snR57snR57 88 nt-3.03□□□□□ -2.89
THO2P53552 YER137W-AYER137W-A 306 nt-3.06□□□□□ -2.9
THO2P53552 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-3.08□□□□□ -2.9
THO2P53552 YER175W-AYER175W-A 165 nt-3.08□□□□□ -2.9
THO2P53552 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-3.09□□□□□ -2.9
THO2P53552 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-3.11□□□□□ -2.91
THO2P53552 YDL158CYDL158C 309 nt-3.12□□□□□ -2.91
THO2P53552 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-3.19□□□□□ -2.92
THO2P53552 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-3.2□□□□□ -2.92
THO2P53552 YER097WYER097W 330 nt-3.2□□□□□ -2.92
THO2P53552 AI5_BETAQ0075 1065 nt-3.21□□□□□ -2.92
THO2P53552 YDL016CYDL016C 303 nt-3.23□□□□□ -2.93
THO2P53552 ATG16YMR159C 453 nt-3.25□□□□□ -2.93
THO2P53552 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-3.27□□□□□ -2.93
THO2P53552 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-3.28□□□□□ -2.93
THO2P53552 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-3.29□□□□□ -2.94
THO2P53552 YPR197CYPR197C 564 nt-3.29□□□□□ -2.94
THO2P53552 YAR047CYAR047C 321 nt-3.31□□□□□ -2.94
THO2P53552 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-3.32□□□□□ -2.94
THO2P53552 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-3.33□□□□□ -2.94
THO2P53552 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-3.34□□□□□ -2.94
THO2P53552 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-3.35□□□□□ -2.95
THO2P53552 YER181CYER181C 324 nt-3.37□□□□□ -2.95
THO2P53552 snR55snR55 98 nt-3.42□□□□□ -2.96
THO2P53552 snR6snR6 112 nt-3.44□□□□□ -2.96
THO2P53552 YFL019CYFL019C 354 nt-3.44□□□□□ -2.96
THO2P53552 YFL032WYFL032W 321 nt-3.45□□□□□ -2.96
THO2P53552 CSN9YDR179C 489 nt-3.48□□□□□ -2.97
THO2P53552 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-3.48□□□□□ -2.97
THO2P53552 YJR157WYJR157W 363 nt-3.48□□□□□ -2.97
THO2P53552 YBR178WYBR178W 375 nt-3.48□□□□□ -2.97
THO2P53552 MPC1YGL080W 393 nt-3.49□□□□□ -2.97
THO2P53552 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-3.5□□□□□ -2.97
THO2P53552 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-3.51□□□□□ -2.97
THO2P53552 snR41snR41 95 nt-3.52□□□□□ -2.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.2 ms