Protein–RNA interactions for Protein: P29478

SEC65, Signal recognition particle subunit SEC65, yeastyeast

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC65P29478 ANS1YHR126C 480 nt1.25□□□□□ -2.21
SEC65P29478 MSH3YCR092C 3057 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC65P29478 FYV10YIL097W 1551 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC65P29478 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.22□□□□□ -2.21
SEC65P29478 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.2□□□□□ -2.22
SEC65P29478 YGL182CYGL182C 324 nt1.19□□□□□ -2.22
SEC65P29478 RPM2YML091C 3609 nt1.17□□□□□ -2.22
SEC65P29478 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.17□□□□□ -2.22
SEC65P29478 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.17□□□□□ -2.22
SEC65P29478 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.17□□□□□ -2.22
SEC65P29478 YOR170WYOR170W 306 nt1.17□□□□□ -2.22
SEC65P29478 snR48snR48 113 nt1.17□□□□□ -2.22
SEC65P29478 SIP4YJL089W 2490 nt1.17□□□□□ -2.22
SEC65P29478 RAD9YDR217C 3930 nt1.17□□□□□ -2.22
SEC65P29478 SNU13YEL026W 381 nt1.16□□□□□ -2.22
SEC65P29478 YOR102WYOR102W 351 nt1.16□□□□□ -2.22
SEC65P29478 TAH1YCR060W 336 nt1.15□□□□□ -2.23
SEC65P29478 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.14□□□□□ -2.23
SEC65P29478 YLR232WYLR232W 348 nt1.14□□□□□ -2.23
SEC65P29478 SPT7YBR081C 3999 nt1.12□□□□□ -2.23
SEC65P29478 FIG2YCR089W 4830 nt1.12□□□□□ -2.23
SEC65P29478 SCC2YDR180W 4482 nt1.11□□□□□ -2.23
SEC65P29478 YDL073WYDL073W 2955 nt1.09□□□□□ -2.23
SEC65P29478 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.09□□□□□ -2.23
SEC65P29478 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.09□□□□□ -2.23
SEC65P29478 YBL053WYBL053W 375 nt1.09□□□□□ -2.23
SEC65P29478 YSP1YHR155W 3687 nt1.09□□□□□ -2.24
SEC65P29478 VAM6YDL077C 3150 nt1.09□□□□□ -2.24
SEC65P29478 YGR130CYGR130C 2451 nt1.09□□□□□ -2.24
SEC65P29478 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.08□□□□□ -2.24
SEC65P29478 CHS6YJL099W 2241 nt1.08□□□□□ -2.24
SEC65P29478 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.07□□□□□ -2.24
SEC65P29478 UBP3YER151C 2739 nt1.07□□□□□ -2.24
SEC65P29478 Q0092Q0092 141 nt1.06□□□□□ -2.24
SEC65P29478 YGR164WYGR164W 336 nt1.06□□□□□ -2.24
SEC65P29478 IML1YJR138W 4755 nt1.06□□□□□ -2.24
SEC65P29478 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
SEC65P29478 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.05□□□□□ -2.24
SEC65P29478 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.05□□□□□ -2.24
SEC65P29478 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
SEC65P29478 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.05□□□□□ -2.24
SEC65P29478 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
SEC65P29478 DOP1YDR141C 5097 nt1.05□□□□□ -2.24
SEC65P29478 OST4YDL232W 111 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC65P29478 ATP8Q0080 147 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC65P29478 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC65P29478 BEM3YPL115C 3387 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC65P29478 YNL170WYNL170W 396 nt1□□□□□ -2.25
SEC65P29478 YPR117WYPR117W 7470 nt0.99□□□□□ -2.25
SEC65P29478 LTE1YAL024C 4308 nt0.99□□□□□ -2.25
SEC65P29478 SDH6YDR379C-A 240 nt0.99□□□□□ -2.25
SEC65P29478 YDR544CYDR544C 429 nt0.99□□□□□ -2.25
SEC65P29478 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.99□□□□□ -2.25
SEC65P29478 PAU24YBR301W 363 nt0.99□□□□□ -2.25
SEC65P29478 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.97□□□□□ -2.25
SEC65P29478 COG6YNL041C 2520 nt0.97□□□□□ -2.25
SEC65P29478 ULP2YIL031W 3105 nt0.96□□□□□ -2.26
SEC65P29478 RKR1YMR247C 4689 nt0.96□□□□□ -2.26
SEC65P29478 QCR9YGR183C 201 nt0.95□□□□□ -2.26
SEC65P29478 YJR029WYJR029W 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
SEC65P29478 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
SEC65P29478 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.92□□□□□ -2.26
SEC65P29478 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.92□□□□□ -2.26
SEC65P29478 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.92□□□□□ -2.26
SEC65P29478 GLG1YKR058W 1851 nt0.92□□□□□ -2.26
SEC65P29478 snR39BsnR39B 96 nt0.91□□□□□ -2.26
SEC65P29478 SEC1YDR164C 2175 nt0.89□□□□□ -2.27
SEC65P29478 NNF2YGR089W 2811 nt0.88□□□□□ -2.27
SEC65P29478 YDR210WYDR210W 228 nt0.87□□□□□ -2.27
SEC65P29478 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.87□□□□□ -2.27
SEC65P29478 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.85□□□□□ -2.27
SEC65P29478 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.83□□□□□ -2.28
SEC65P29478 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.81□□□□□ -2.28
SEC65P29478 BUL2YML111W 2763 nt0.8□□□□□ -2.28
SEC65P29478 PET111YMR257C 2403 nt0.8□□□□□ -2.28
SEC65P29478 NIP1YMR309C 2439 nt0.79□□□□□ -2.28
SEC65P29478 SOM1YEL059C-A 225 nt0.79□□□□□ -2.28
SEC65P29478 MLP1YKR095W 5628 nt0.78□□□□□ -2.28
SEC65P29478 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.76□□□□□ -2.29
SEC65P29478 IQG1YPL242C 4488 nt0.75□□□□□ -2.29
SEC65P29478 BUD3YCL014W 4911 nt0.75□□□□□ -2.29
SEC65P29478 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 RPS26AYGL189C 360 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 PAU12YGR294W 363 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 YNL205CYNL205C 423 nt0.74□□□□□ -2.29
SEC65P29478 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.73□□□□□ -2.29
SEC65P29478 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.72□□□□□ -2.29
SEC65P29478 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.72□□□□□ -2.29
SEC65P29478 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.72□□□□□ -2.29
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