Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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