Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM106CQ9BVX2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.6 ms