Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms