Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms