Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms