Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 IFH1YLR223C 3258 nt1.29□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 NUP188YML103C 4968 nt1.29□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 YLL020CYLL020C 306 nt1.29□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 YBR206WYBR206W 324 nt1.29□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 YDL206WYDL206W 2289 nt1.28□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 AIM44YPL158C 2277 nt1.28□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 APL3YBL037W 3078 nt1.28□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 ROM2YLR371W 4071 nt1.27□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 SGF11YPL047W 300 nt1.27□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 AHC1YOR023C 1701 nt1.26□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.26□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.26□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.26□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 BLI1YKL061W 342 nt1.26□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 YOR302WYOR302W 78 nt1.26□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 MMS4YBR098W 2076 nt1.26□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 FIG4YNL325C 2640 nt1.26□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 MDS3YGL197W 4464 nt1.26□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 PIK1YNL267W 3201 nt1.25□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 ECM12YHR021W-A 456 nt1.25□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.25□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 RPL33BYOR234C 324 nt1.25□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.25□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 SLD3YGL113W 2007 nt1.25□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 SIP4YJL089W 2490 nt1.25□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 PAU12YGR294W 363 nt1.23□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.23□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 PAU24YBR301W 363 nt1.23□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 YKU70YMR284W 1809 nt1.23□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 EAF1YDR359C 2949 nt1.23□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.22□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.22□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.22□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 STB6YKL072W 2301 nt1.22□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 NST1YNL091W 3723 nt1.22□□□□□ -2.21
CTF3Q12748 APQ12YIL040W 417 nt1.21□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 SET3YKR029C 2256 nt1.2□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 YAR009CYAR009C 3591 nt1.2□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 PAN2YGL094C 3348 nt1.2□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 STO1YMR125W 2586 nt1.2□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 SMC1YFL008W 3678 nt1.2□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 CDC39YCR093W 6327 nt1.2□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.19□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.18□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 OLI1Q0130 231 nt1.18□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 RAD9YDR217C 3930 nt1.18□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 YDL196WYDL196W 330 nt1.17□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 ISD11YER048W-A 285 nt1.17□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 PAM16YJL104W 450 nt1.17□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.17□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 NUP157YER105C 4176 nt1.17□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 ULI1YFR026C 510 nt1.16□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.16□□□□□ -2.22
CTF3Q12748 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.15□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 YOR345CYOR345C 351 nt1.15□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 WAR1YML076C 2835 nt1.15□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 GEA2YEL022W 4380 nt1.14□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.14□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 YEL014CYEL014C 306 nt1.14□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 RPS30BYOR182C 192 nt1.14□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 YNL337WYNL337W 255 nt1.13□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.12□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 YNL211CYNL211C 261 nt1.12□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 APL1YJR005W 2103 nt1.12□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 DOP1YDR141C 5097 nt1.11□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.11□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.11□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 SPT7YBR081C 3999 nt1.1□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 PAA1YDR071C 576 nt1.1□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 UBP3YER151C 2739 nt1.09□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.09□□□□□ -2.23
CTF3Q12748 CMC4YMR194C-B 222 nt1.08□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.07□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.07□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.07□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.07□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.07□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.07□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.07□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.07□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 KAP120YPL125W 3099 nt1.06□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 YNL198CYNL198C 303 nt1.06□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 NOP9YJL010C 2001 nt1.06□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 YJR029WYJR029W 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 QCR9YGR183C 201 nt1.05□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 BEM2YER155C 6504 nt1.04□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.04□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 YPL044CYPL044C 549 nt1.04□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 snR52snR52 92 nt1.04□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.03□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 COX12YLR038C 252 nt1.03□□□□□ -2.24
CTF3Q12748 COY1YKL179C 2040 nt1.03□□□□□ -2.25
CTF3Q12748 YJL150WYJL150W 303 nt1.02□□□□□ -2.25
CTF3Q12748 UTP20YBL004W 7482 nt1.02□□□□□ -2.25
CTF3Q12748 snR46snR46 197 nt1.02□□□□□ -2.25
CTF3Q12748 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.01□□□□□ -2.25
CTF3Q12748 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1□□□□□ -2.25
CTF3Q12748 RPL26BYGR034W 384 nt1□□□□□ -2.25
CTF3Q12748 YJL182CYJL182C 318 nt1□□□□□ -2.25
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