Protein–RNA interactions for Protein: Q12504

RKM4, Ribosomal lysine N-methyltransferase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKM4Q12504 TRM3YDL112W 4311 nt2.02□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 RAD50YNL250W 3939 nt2.02□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 KIP1YBL063W 3336 nt2.02□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 APL1YJR005W 2103 nt2.02□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 LHS1YKL073W 2646 nt2.02□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 YDL206WYDL206W 2289 nt2.01□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 GCN2YDR283C 4980 nt2.01□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 TTI1YKL033W 3117 nt2□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 snR85snR85 171 nt1.99□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.99□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 ALY2YJL084C 3141 nt1.99□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 TBS1YBR150C 3285 nt1.98□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.97□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 YOR102WYOR102W 351 nt1.97□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 CTF4YPR135W 2784 nt1.97□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 UFD2YDL190C 2886 nt1.96□□□□□ -2.09
RKM4Q12504 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.96□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 YNL211CYNL211C 261 nt1.96□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 SKI3YPR189W 4299 nt1.96□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 SLX4YLR135W 2247 nt1.95□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.95□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.95□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 POL5YEL055C 3069 nt1.95□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 PAN2YGL094C 3348 nt1.94□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 SMC4YLR086W 4257 nt1.94□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 KCS1YDR017C 3153 nt1.94□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 MMS4YBR098W 2076 nt1.94□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 BRR2YER172C 6492 nt1.93□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 MYO2YOR326W 4725 nt1.92□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 YJL022WYJL022W 309 nt1.92□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 COA6YMR244C-A 315 nt1.92□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 snR14snR14 160 nt1.92□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 MON2YNL297C 4911 nt1.92□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.91□□□□□ -2.1
RKM4Q12504 PRP5YBR237W 2550 nt1.9□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 VPS15YBR097W 4365 nt1.9□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 DNF3YMR162C 4971 nt1.9□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 YAR009CYAR009C 3591 nt1.89□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 RTP1YMR185W 2946 nt1.88□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.87□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 RSM22YKL155C 1887 nt1.87□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 PKH3YDR466W 2697 nt1.87□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 YLL054CYLL054C 2532 nt1.87□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.86□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 CFT1YDR301W 4074 nt1.86□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 YCS4YLR272C 3531 nt1.86□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 KAP122YGL016W 3246 nt1.85□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.85□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 CDC31YOR257W 486 nt1.85□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 YOR019WYOR019W 2193 nt1.84□□□□□ -2.11
RKM4Q12504 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.83□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 SMC1YFL008W 3678 nt1.82□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.82□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 BFR2YDR299W 1605 nt1.81□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.81□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 STO1YMR125W 2586 nt1.81□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 FIG2YCR089W 4830 nt1.8□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 SET3YKR029C 2256 nt1.8□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.8□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 YLR422WYLR422W 5799 nt1.79□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 COX5BYIL111W 456 nt1.79□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 UTP8YGR128C 2142 nt1.79□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 YGL182CYGL182C 324 nt1.78□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 CMC4YMR194C-B 222 nt1.78□□□□□ -2.12
RKM4Q12504 NUP192YJL039C 5052 nt1.78□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 PMD1YER132C 5262 nt1.77□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 YLL020CYLL020C 306 nt1.77□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 YLR282CYLR282C 342 nt1.77□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 TRM732YMR259C 4263 nt1.76□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 EAF1YDR359C 2949 nt1.76□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 NOP9YJL010C 2001 nt1.76□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 NUP157YER105C 4176 nt1.75□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 CHS6YJL099W 2241 nt1.75□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.74□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 PIK1YNL267W 3201 nt1.74□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 WAR1YML076C 2835 nt1.74□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 SWI4YER111C 3282 nt1.73□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.73□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 MEC1YBR136W 7107 nt1.73□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 BST1YFL025C 3090 nt1.72□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 APL3YBL037W 3078 nt1.72□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 YML002WYML002W 2214 nt1.72□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 STB6YKL072W 2301 nt1.72□□□□□ -2.13
RKM4Q12504 CHS1YNL192W 3396 nt1.7□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 GEA2YEL022W 4380 nt1.69□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 TAH1YCR060W 336 nt1.69□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 NUP188YML103C 4968 nt1.68□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 CAT8YMR280C 4302 nt1.68□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 YLR041WYLR041W 321 nt1.67□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 snR190snR190 190 nt1.67□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.67□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 OST4YDL232W 111 nt1.66□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 RPL26BYGR034W 384 nt1.66□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 ASE1YOR058C 2658 nt1.66□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 NUP145YGL092W 3954 nt1.66□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 SEC21YNL287W 2808 nt1.66□□□□□ -2.14
RKM4Q12504 FYV10YIL097W 1551 nt1.65□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 AZF1YOR113W 2745 nt1.65□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 SEC3YER008C 4011 nt1.64□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.64□□□□□ -2.15
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