Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 RAV1YJR033C 4074 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 snR53snR53 91 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 PAN2YGL094C 3348 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 TOR1YJR066W 7413 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 UTP21YLR409C 2820 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 RGC1YPR115W 3252 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 NAB6YML117W 3405 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 KRE33YNL132W 3171 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 SVL3YPL032C 2478 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 ALY2YJL084C 3141 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 MSH6YDR097C 3729 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 RPS26AYGL189C 360 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 YLR041WYLR041W 321 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 HIR3YJR140C 4947 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 YOR055WYOR055W 435 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 RAD50YNL250W 3939 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 SPF1YEL031W 3648 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 KOG1YHR186C 4674 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 YPR097WYPR097W 3222 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 NUT1YGL151W 3399 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 PSD2YGR170W 3417 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 DNF1YER166W 4716 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 HER1YOR227W 3741 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 YAR009CYAR009C 3591 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 CHS1YNL192W 3396 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 NUP157YER105C 4176 nt2.17□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 PDR3YBL005W 2931 nt2.17□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 TDA9YML081W 3756 nt2.17□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 KIP1YBL063W 3336 nt2.17□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 IRA2YOL081W 9240 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 TIM9YEL020W-A 264 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 snR47snR47 99 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 HSL1YKL101W 4557 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 CSF1YLR087C 8877 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1A-DR3Q12441 RPM2YML091C 3609 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 snR190snR190 190 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 EMC5YIL027C 426 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 YOL098CYOL098C 3114 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 NOP9YJL010C 2001 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 MYO4YAL029C 4416 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 snR64snR64 101 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 BCK1YJL095W 4437 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 YPL216WYPL216W 3309 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 SEC10YLR166C 2616 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 RAD9YDR217C 3930 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 RPL26BYGR034W 384 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 snR50snR50 90 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 YOR296WYOR296W 3870 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 RGA1YOR127W 3024 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 ROM2YLR371W 4071 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-DR3Q12441 PDR1YGL013C 3207 nt2.09□□□□□ -2.08
TY1A-DR3Q12441 SLN1YIL147C 3663 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1A-DR3Q12441 BEM3YPL115C 3387 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1A-DR3Q12441 DBP10YDL031W 2988 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1A-DR3Q12441 VPS13YLL040C 9435 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1A-DR3Q12441 GLG1YKR058W 1851 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1A-DR3Q12441 STH1YIL126W 4080 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1A-DR3Q12441 BNI1YNL271C 5862 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1A-DR3Q12441 PAU10YDR542W 363 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1A-DR3Q12441 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1A-DR3Q12441 PAU4YLR461W 363 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1A-DR3Q12441 WAR1YML076C 2835 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1A-DR3Q12441 ORC3YLL004W 1851 nt2.03□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 SGS1YMR190C 4344 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 INO80YGL150C 4470 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 ASE1YOR058C 2658 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 SMC4YLR086W 4257 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 YDL073WYDL073W 2955 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 STO1YMR125W 2586 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 snR14snR14 160 nt2□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 UBP3YER151C 2739 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 PRP16YKR086W 3216 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 UBP2YOR124C 3819 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 TFC3YAL001C 3483 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 YLR422WYLR422W 5799 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 SPP41YDR464W 4308 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 SEC16YPL085W 6588 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 APL3YBL037W 3078 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 GEA2YEL022W 4380 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1A-DR3Q12441 AZF1YOR113W 2745 nt1.97□□□□□ -2.09
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