Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.38□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 TAR1YLR154W-C 375 nt0.38□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 YOR282WYOR282W 321 nt0.38□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.37□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 YDR048CYDR048C 315 nt0.37□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 RPL26BYGR034W 384 nt0.37□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 YIR044CYIR044C 186 nt0.37□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 YPL044CYPL044C 549 nt0.37□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 YPL225WYPL225W 441 nt0.37□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 PTP2YOR208W 2253 nt0.36□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 UTP20YBL004W 7482 nt0.36□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.36□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 YJL120WYJL120W 324 nt0.36□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 HTB2YBL002W 396 nt0.36□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 RPS25BYLR333C 327 nt0.36□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.35□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 YMR321CYMR321C 318 nt0.35□□□□□ -2.35
RIO1Q12196 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.34□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.33□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.33□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.33□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.33□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.33□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.33□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.33□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.33□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.33□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.33□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 FYV10YIL097W 1551 nt0.32□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 YSP1YHR155W 3687 nt0.32□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 HMRA2YCR096C 360 nt0.32□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.32□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 COG8YML071C 1824 nt0.31□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 YDR157WYDR157W 402 nt0.31□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.31□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.31□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 PRP5YBR237W 2550 nt0.3□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.3□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 YGR035CYGR035C 351 nt0.3□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 PAU12YGR294W 363 nt0.3□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.3□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 BIL1YOR304C-A 231 nt0.3□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 COX5BYIL111W 456 nt0.29□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 ABF2YMR072W 552 nt0.29□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 YAF9YNL107W 681 nt0.29□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 YOR345CYOR345C 351 nt0.29□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 PAA1YDR071C 576 nt0.28□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 SBH1YER087C-B 249 nt0.28□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 snR190snR190 190 nt0.28□□□□□ -2.36
RIO1Q12196 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.27□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 snR60snR60 104 nt0.27□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.27□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 YPR092WYPR092W 306 nt0.27□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.27□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.27□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 IQG1YPL242C 4488 nt0.26□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 OST4YDL232W 111 nt0.26□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.26□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 COY1YKL179C 2040 nt0.26□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 ORC3YLL004W 1851 nt0.25□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 PET111YMR257C 2403 nt0.25□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 ULI1YFR026C 510 nt0.24□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 PRP42YDR235W 1635 nt0.24□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 VIK1YPL253C 1944 nt0.23□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 YDR102CYDR102C 333 nt0.23□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 RPS27BYHR021C 249 nt0.23□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.23□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.23□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 TRS65YGR166W 1683 nt0.23□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 AI1Q0050 2505 nt0.22□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 BEM3YPL115C 3387 nt0.22□□□□□ -2.37
RIO1Q12196 SEC8YPR055W 3198 nt0.21□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.21□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.21□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YLR282CYLR282C 342 nt0.21□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 BIR1YJR089W 2865 nt0.21□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YIL032CYIL032C 357 nt0.2□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YKL136WYKL136W 399 nt0.2□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YOL014WYOL014W 375 nt0.2□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YOR015WYOR015W 360 nt0.2□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YFL019CYFL019C 354 nt0.19□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 RPS26AYGL189C 360 nt0.19□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.19□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.19□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.18□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 snR36snR36 182 nt0.18□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YCR022CYCR022C 345 nt0.17□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YGR069WYGR069W 336 nt0.17□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.17□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 HAL9YOL089C 3093 nt0.17□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.17□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 NNF2YGR089W 2811 nt0.16□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YFL032WYFL032W 321 nt0.16□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.16□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 QCR9YGR183C 201 nt0.16□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 CSE2YNR010W 450 nt0.16□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 YPR197CYPR197C 564 nt0.16□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 RCO1YMR075W 2055 nt0.15□□□□□ -2.38
RIO1Q12196 snR74snR74 88 nt0.15□□□□□ -2.39
RIO1Q12196 YNL146WYNL146W 303 nt0.15□□□□□ -2.39
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