Protein–RNA interactions for Protein: Q02820

NCE101, Non-classical export protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCE101Q02820 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-3.46□□□□□ -2.96
NCE101Q02820 YER138W-AYER138W-A 105 nt-3.47□□□□□ -2.96
NCE101Q02820 DFG10YIL049W 762 nt-3.47□□□□□ -2.96
NCE101Q02820 RUF20RUF20 443 nt-3.47□□□□□ -2.96
NCE101Q02820 IRC16YPR038W 360 nt-3.47□□□□□ -2.96
NCE101Q02820 YGL052WYGL052W 306 nt-3.48□□□□□ -2.97
NCE101Q02820 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-3.5□□□□□ -2.97
NCE101Q02820 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-3.51□□□□□ -2.97
NCE101Q02820 YGL042CYGL042C 306 nt-3.52□□□□□ -2.97
NCE101Q02820 YER046W-AYER046W-A 330 nt-3.53□□□□□ -2.97
NCE101Q02820 YGL015CYGL015C 393 nt-3.53□□□□□ -2.97
NCE101Q02820 YKL115CYKL115C 393 nt-3.53□□□□□ -2.97
NCE101Q02820 RPL22BYFL034C-A 369 nt-3.55□□□□□ -2.98
NCE101Q02820 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-3.55□□□□□ -2.98
NCE101Q02820 YER158W-AYER158W-A 216 nt-3.56□□□□□ -2.98
NCE101Q02820 YGL239CYGL239C 315 nt-3.56□□□□□ -2.98
NCE101Q02820 YHL012WYHL012W 1482 nt-3.56□□□□□ -2.98
NCE101Q02820 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-3.58□□□□□ -2.98
NCE101Q02820 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-3.58□□□□□ -2.98
NCE101Q02820 SPO12YHR152W 522 nt-3.59□□□□□ -2.98
NCE101Q02820 YPR099CYPR099C 357 nt-3.59□□□□□ -2.98
NCE101Q02820 YHR125WYHR125W 306 nt-3.6□□□□□ -2.99
NCE101Q02820 YDR290WYDR290W 330 nt-3.61□□□□□ -2.99
NCE101Q02820 YIR044CYIR044C 186 nt-3.61□□□□□ -2.99
NCE101Q02820 CUP1-1YHR053C 186 nt-3.63□□□□□ -2.99
NCE101Q02820 CUP1-2YHR055C 186 nt-3.63□□□□□ -2.99
NCE101Q02820 YKL044WYKL044W 321 nt-3.63□□□□□ -2.99
NCE101Q02820 YPL229WYPL229W 621 nt-3.64□□□□□ -2.99
NCE101Q02820 ATP20YPR020W 348 nt-3.65□□□□□ -2.99
NCE101Q02820 snR39BsnR39B 96 nt-3.66□□□□□ -3
NCE101Q02820 Q0142Q0142 177 nt-3.68□□□□□ -3
NCE101Q02820 RSM18YER050C 417 nt-3.69□□□□□ -3
NCE101Q02820 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-3.69□□□□□ -3
NCE101Q02820 JLP2YMR132C 627 nt-3.7□□□□□ -3
NCE101Q02820 YBR285WYBR285W 435 nt-3.71□□□□□ -3
NCE101Q02820 YJL032WYJL032W 315 nt-3.74□□□□□ -3.01
NCE101Q02820 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-3.74□□□□□ -3.01
NCE101Q02820 snR79snR79 84 nt-3.75□□□□□ -3.01
NCE101Q02820 YGR228WYGR228W 345 nt-3.75□□□□□ -3.01
NCE101Q02820 snR5snR5 204 nt-3.77□□□□□ -3.01
NCE101Q02820 RPL29YFR032C-A 180 nt-3.77□□□□□ -3.01
NCE101Q02820 YDR269CYDR269C 324 nt-3.78□□□□□ -3.01
NCE101Q02820 YPL261CYPL261C 309 nt-3.79□□□□□ -3.02
NCE101Q02820 snR77snR77 88 nt-3.8□□□□□ -3.02
NCE101Q02820 YAL069WYAL069W 315 nt-3.8□□□□□ -3.02
NCE101Q02820 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-3.81□□□□□ -3.02
NCE101Q02820 YBR051WYBR051W 351 nt-3.81□□□□□ -3.02
NCE101Q02820 THG1YGR024C 714 nt-3.83□□□□□ -3.02
NCE101Q02820 YML047W-AYML047W-A 366 nt-3.83□□□□□ -3.02
NCE101Q02820 YER053C-AYER053C-A 114 nt-3.84□□□□□ -3.02
NCE101Q02820 RPS27BYHR021C 249 nt-3.84□□□□□ -3.02
NCE101Q02820 YIM2YMR151W 438 nt-3.84□□□□□ -3.02
NCE101Q02820 PET20YPL159C 762 nt-3.88□□□□□ -3.03
NCE101Q02820 SGF11YPL047W 300 nt-3.89□□□□□ -3.03
NCE101Q02820 MND1YGL183C 660 nt-3.9□□□□□ -3.03
NCE101Q02820 YKL063CYKL063C 504 nt-3.92□□□□□ -3.04
NCE101Q02820 SMD2YLR275W 333 nt-3.92□□□□□ -3.04
NCE101Q02820 YNL205CYNL205C 423 nt-3.92□□□□□ -3.04
NCE101Q02820 COX7YMR256C 183 nt-3.95□□□□□ -3.04
NCE101Q02820 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt-3.97□□□□□ -3.04
NCE101Q02820 snR72snR72 98 nt-3.99□□□□□ -3.05
NCE101Q02820 YDR366CYDR366C 399 nt-3.99□□□□□ -3.05
NCE101Q02820 YNL058CYNL058C 951 nt-4□□□□□ -3.05
NCE101Q02820 SDH6YDR379C-A 240 nt-4.02□□□□□ -3.05
NCE101Q02820 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-4.02□□□□□ -3.05
NCE101Q02820 YOR121CYOR121C 306 nt-4.02□□□□□ -3.05
NCE101Q02820 RPS30AYLR287C-A 192 nt-4.04□□□□□ -3.06
NCE101Q02820 ATP19YOL077W-A 207 nt-4.05□□□□□ -3.06
NCE101Q02820 YPT6YLR262C 648 nt-4.07□□□□□ -3.06
NCE101Q02820 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt-4.09□□□□□ -3.06
NCE101Q02820 YOR309CYOR309C 381 nt-4.09□□□□□ -3.06
NCE101Q02820 CMS1YLR003C 876 nt-4.1□□□□□ -3.07
NCE101Q02820 IRC13YOR235W 315 nt-4.1□□□□□ -3.07
NCE101Q02820 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-4.12□□□□□ -3.07
NCE101Q02820 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-4.13□□□□□ -3.07
NCE101Q02820 CSE2YNR010W 450 nt-4.13□□□□□ -3.07
NCE101Q02820 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-4.14□□□□□ -3.07
NCE101Q02820 YLR202CYLR202C 327 nt-4.18□□□□□ -3.08
NCE101Q02820 YGR025WYGR025W 303 nt-4.19□□□□□ -3.08
NCE101Q02820 YDR048CYDR048C 315 nt-4.21□□□□□ -3.08
NCE101Q02820 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-4.21□□□□□ -3.08
NCE101Q02820 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-4.22□□□□□ -3.08
NCE101Q02820 MRPL32YCR003W 552 nt-4.25□□□□□ -3.09
NCE101Q02820 AIM29YKR074W 468 nt-4.25□□□□□ -3.09
NCE101Q02820 BI2Q0110 1272 nt-4.26□□□□□ -3.09
NCE101Q02820 YML054C-AYML054C-A 159 nt-4.27□□□□□ -3.09
NCE101Q02820 CWC23YGL128C 852 nt-4.3□□□□□ -3.1
NCE101Q02820 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-4.33□□□□□ -3.1
NCE101Q02820 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-4.33□□□□□ -3.1
NCE101Q02820 POP7YBR167C 423 nt-4.33□□□□□ -3.1
NCE101Q02820 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-4.34□□□□□ -3.1
NCE101Q02820 YKL202WYKL202W 582 nt-4.35□□□□□ -3.11
NCE101Q02820 YJR087WYJR087W 351 nt-4.36□□□□□ -3.11
NCE101Q02820 YNL266WYNL266W 420 nt-4.37□□□□□ -3.11
NCE101Q02820 ZEO1YOL109W 342 nt-4.38□□□□□ -3.11
NCE101Q02820 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-4.4□□□□□ -3.11
NCE101Q02820 snR51snR51 107 nt-4.4□□□□□ -3.11
NCE101Q02820 YJL086CYJL086C 369 nt-4.41□□□□□ -3.12
NCE101Q02820 YER090C-AYER090C-A 90 nt-4.46□□□□□ -3.12
NCE101Q02820 FYV7YLR068W 456 nt-4.46□□□□□ -3.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 79.6 ms