Protein–RNA interactions for Protein: P53312

LSC2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSC2P53312 ISW1YBR245C 3390 nt2.54□□□□□ -2
LSC2P53312 ASE1YOR058C 2658 nt2.54□□□□□ -2
LSC2P53312 SSN2YDR443C 4263 nt2.54□□□□□ -2
LSC2P53312 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt2.53□□□□□ -2
LSC2P53312 ESC1YMR219W 4977 nt2.52□□□□□ -2.01
LSC2P53312 SMC6YLR383W 3345 nt2.52□□□□□ -2.01
LSC2P53312 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.52□□□□□ -2.01
LSC2P53312 PDR11YIL013C 4236 nt2.52□□□□□ -2.01
LSC2P53312 TFC3YAL001C 3483 nt2.51□□□□□ -2.01
LSC2P53312 MET18YIL128W 3099 nt2.51□□□□□ -2.01
LSC2P53312 ADR1YDR216W 3972 nt2.51□□□□□ -2.01
LSC2P53312 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
LSC2P53312 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.5□□□□□ -2.01
LSC2P53312 AGC1YPR021C 2709 nt2.5□□□□□ -2.01
LSC2P53312 BUD2YKL092C 3315 nt2.5□□□□□ -2.01
LSC2P53312 SCD5YOR329C 2619 nt2.49□□□□□ -2.01
LSC2P53312 snR47snR47 99 nt2.49□□□□□ -2.01
LSC2P53312 YEF3YLR249W 3135 nt2.49□□□□□ -2.01
LSC2P53312 YER078W-AYER078W-A 165 nt2.48□□□□□ -2.01
LSC2P53312 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.48□□□□□ -2.01
LSC2P53312 snR50snR50 90 nt2.48□□□□□ -2.01
LSC2P53312 AMS1YGL156W 3252 nt2.48□□□□□ -2.01
LSC2P53312 FRK1YPL141C 2598 nt2.47□□□□□ -2.01
LSC2P53312 VPS13YLL040C 9435 nt2.47□□□□□ -2.01
LSC2P53312 SPF1YEL031W 3648 nt2.46□□□□□ -2.02
LSC2P53312 RSM22YKL155C 1887 nt2.46□□□□□ -2.02
LSC2P53312 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.45□□□□□ -2.02
LSC2P53312 HSL1YKL101W 4557 nt2.45□□□□□ -2.02
LSC2P53312 YML002WYML002W 2214 nt2.45□□□□□ -2.02
LSC2P53312 TRM3YDL112W 4311 nt2.44□□□□□ -2.02
LSC2P53312 NOP9YJL010C 2001 nt2.44□□□□□ -2.02
LSC2P53312 UBR1YGR184C 5853 nt2.43□□□□□ -2.02
LSC2P53312 TRL1YJL087C 2484 nt2.43□□□□□ -2.02
LSC2P53312 YLR041WYLR041W 321 nt2.43□□□□□ -2.02
LSC2P53312 COA6YMR244C-A 315 nt2.43□□□□□ -2.02
LSC2P53312 NUP100YKL068W 2880 nt2.43□□□□□ -2.02
LSC2P53312 GEA1YJR031C 4227 nt2.42□□□□□ -2.02
LSC2P53312 SEC21YNL287W 2808 nt2.41□□□□□ -2.02
LSC2P53312 SEY1YOR165W 2331 nt2.41□□□□□ -2.02
LSC2P53312 TIM9YEL020W-A 264 nt2.41□□□□□ -2.02
LSC2P53312 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.4□□□□□ -2.02
LSC2P53312 CTR9YOL145C 3234 nt2.39□□□□□ -2.03
LSC2P53312 RAD9YDR217C 3930 nt2.39□□□□□ -2.03
LSC2P53312 PSD2YGR170W 3417 nt2.39□□□□□ -2.03
LSC2P53312 ALY2YJL084C 3141 nt2.38□□□□□ -2.03
LSC2P53312 INO80YGL150C 4470 nt2.38□□□□□ -2.03
LSC2P53312 RGA1YOR127W 3024 nt2.38□□□□□ -2.03
LSC2P53312 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.38□□□□□ -2.03
LSC2P53312 CHC1YGL206C 4962 nt2.38□□□□□ -2.03
LSC2P53312 TUS1YLR425W 3924 nt2.37□□□□□ -2.03
LSC2P53312 TOP2YNL088W 4287 nt2.37□□□□□ -2.03
LSC2P53312 DGR1YNL130C-A 147 nt2.37□□□□□ -2.03
LSC2P53312 UTP22YGR090W 3714 nt2.37□□□□□ -2.03
LSC2P53312 CDC60YPL160W 3273 nt2.37□□□□□ -2.03
LSC2P53312 UFD4YKL010C 4452 nt2.36□□□□□ -2.03
LSC2P53312 YDL073WYDL073W 2955 nt2.36□□□□□ -2.03
LSC2P53312 UBP3YER151C 2739 nt2.36□□□□□ -2.03
LSC2P53312 TRA1YHR099W 11235 nt2.35□□□□□ -2.03
LSC2P53312 NAB6YML117W 3405 nt2.35□□□□□ -2.03
LSC2P53312 TRS130YMR218C 3309 nt2.34□□□□□ -2.03
LSC2P53312 snR75snR75 89 nt2.34□□□□□ -2.03
LSC2P53312 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt2.34□□□□□ -2.03
LSC2P53312 YOL098CYOL098C 3114 nt2.34□□□□□ -2.04
LSC2P53312 GCN2YDR283C 4980 nt2.32□□□□□ -2.04
LSC2P53312 SYH1YPL105C 2550 nt2.32□□□□□ -2.04
LSC2P53312 AZF1YOR113W 2745 nt2.32□□□□□ -2.04
LSC2P53312 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt2.32□□□□□ -2.04
LSC2P53312 WAR1YML076C 2835 nt2.32□□□□□ -2.04
LSC2P53312 HIR3YJR140C 4947 nt2.32□□□□□ -2.04
LSC2P53312 IRA2YOL081W 9240 nt2.32□□□□□ -2.04
LSC2P53312 SEC10YLR166C 2616 nt2.32□□□□□ -2.04
LSC2P53312 RPM2YML091C 3609 nt2.31□□□□□ -2.04
LSC2P53312 MMS4YBR098W 2076 nt2.31□□□□□ -2.04
LSC2P53312 RPS29AYLR388W 171 nt2.31□□□□□ -2.04
LSC2P53312 SPO24YPR036W-A 204 nt2.31□□□□□ -2.04
LSC2P53312 PAN2YGL094C 3348 nt2.3□□□□□ -2.04
LSC2P53312 NUT1YGL151W 3399 nt2.3□□□□□ -2.04
LSC2P53312 SPP41YDR464W 4308 nt2.29□□□□□ -2.04
LSC2P53312 YPR097WYPR097W 3222 nt2.29□□□□□ -2.04
LSC2P53312 RPL26BYGR034W 384 nt2.29□□□□□ -2.04
LSC2P53312 FAR11YNL127W 2862 nt2.29□□□□□ -2.04
LSC2P53312 IRE1YHR079C 3348 nt2.29□□□□□ -2.04
LSC2P53312 TOF1YNL273W 3717 nt2.28□□□□□ -2.04
LSC2P53312 YKL225WYKL225W 348 nt2.28□□□□□ -2.04
LSC2P53312 SSD1YDR293C 3753 nt2.28□□□□□ -2.05
LSC2P53312 MYO2YOR326W 4725 nt2.27□□□□□ -2.05
LSC2P53312 NUP170YBL079W 4509 nt2.27□□□□□ -2.05
LSC2P53312 GIP3YPL137C 3831 nt2.27□□□□□ -2.05
LSC2P53312 BRE1YDL074C 2103 nt2.27□□□□□ -2.05
LSC2P53312 PIK1YNL267W 3201 nt2.27□□□□□ -2.05
LSC2P53312 KRE33YNL132W 3171 nt2.26□□□□□ -2.05
LSC2P53312 SEC31YDL195W 3822 nt2.26□□□□□ -2.05
LSC2P53312 YLR419WYLR419W 4308 nt2.26□□□□□ -2.05
LSC2P53312 SFB2YNL049C 2631 nt2.25□□□□□ -2.05
LSC2P53312 YAR009CYAR009C 3591 nt2.24□□□□□ -2.05
LSC2P53312 NNF2YGR089W 2811 nt2.24□□□□□ -2.05
LSC2P53312 RAV1YJR033C 4074 nt2.24□□□□□ -2.05
LSC2P53312 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.23□□□□□ -2.05
LSC2P53312 SEC16YPL085W 6588 nt2.23□□□□□ -2.05
LSC2P53312 PET309YLR067C 2898 nt2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56 ms