Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB3Q9UKI3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms