Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.7 ms