Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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EXT1Q16394 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXT1Q16394 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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EXT1Q16394 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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EXT1Q16394 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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EXT1Q16394 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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EXT1Q16394 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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EXT1Q16394 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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EXT1Q16394 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXT1Q16394 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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