Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
EEA1Q15075 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
EEA1Q15075 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms