Protein–RNA interactions for Protein: Q12443

RTN2, Reticulon-like protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTN2Q12443 HTB2YBL002W 396 nt1.22□□□□□ -2.21
RTN2Q12443 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.21□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 YLL007CYLL007C 1998 nt1.21□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 NUP157YER105C 4176 nt1.2□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.2□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.2□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.2□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.2□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.2□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.2□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.2□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 YJR011CYJR011C 786 nt1.2□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 YAR009CYAR009C 3591 nt1.19□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 CDC36YDL165W 576 nt1.19□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.19□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 CDC39YCR093W 6327 nt1.19□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 RPL35AYDL191W 363 nt1.18□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 RPL34BYIL052C 366 nt1.18□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.18□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 NST1YNL091W 3723 nt1.17□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.17□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 WAR1YML076C 2835 nt1.17□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 OST1YJL002C 1431 nt1.16□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.16□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 snR56snR56 88 nt1.16□□□□□ -2.22
RTN2Q12443 YDR521WYDR521W 336 nt1.15□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 YAR029WYAR029W 225 nt1.15□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 YPR197CYPR197C 564 nt1.15□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 HMRA2YCR096C 360 nt1.14□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 GIM4YEL003W 336 nt1.14□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 YHL042WYHL042W 453 nt1.14□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 RPL33BYOR234C 324 nt1.14□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 YCK3YER123W 1575 nt1.13□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.12□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 MSH3YCR092C 3057 nt1.12□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 TAR1YLR154W-C 375 nt1.11□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.11□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 SMC1YFL008W 3678 nt1.09□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.09□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 YBR206WYBR206W 324 nt1.09□□□□□ -2.23
RTN2Q12443 TTI1YKL033W 3117 nt1.08□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 APL1YJR005W 2103 nt1.08□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 VAM6YDL077C 3150 nt1.08□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 YDR048CYDR048C 315 nt1.07□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 YAF9YNL107W 681 nt1.07□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 DOP1YDR141C 5097 nt1.07□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.06□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 ISD11YER048W-A 285 nt1.06□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 KAP120YPL125W 3099 nt1.05□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 YDR102CYDR102C 333 nt1.05□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 SPT7YBR081C 3999 nt1.04□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.04□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 RPS25BYLR333C 327 nt1.04□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 YBR064WYBR064W 429 nt1.04□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 SPO75YLL005C 2607 nt1.04□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 YGR130CYGR130C 2451 nt1.04□□□□□ -2.24
RTN2Q12443 YDL196WYDL196W 330 nt1.02□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 ATP6Q0085 780 nt1.02□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 YMR321CYMR321C 318 nt1.02□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.02□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 YOR282WYOR282W 321 nt1.02□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 SCC2YDR180W 4482 nt1.02□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 OLI1Q0130 231 nt1.01□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 YJL120WYJL120W 324 nt1.01□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 YPL225WYPL225W 441 nt1.01□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 YJR029WYJR029W 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 GEA2YEL022W 4380 nt1.01□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 DBP6YNR038W 1890 nt1□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.99□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 SPO21YOL091W 1830 nt0.99□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 BEM2YER155C 6504 nt0.98□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 SSS1YDR086C 243 nt0.98□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 ALG13YGL047W 609 nt0.98□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 YPR117WYPR117W 7470 nt0.97□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 HTL1YCR020W-B 237 nt0.97□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 PAA1YDR071C 576 nt0.97□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 IES4YOR189W 351 nt0.97□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 YPL044CYPL044C 549 nt0.97□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 SIP4YJL089W 2490 nt0.97□□□□□ -2.25
RTN2Q12443 NOP9YJL010C 2001 nt0.96□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 ECM12YHR021W-A 456 nt0.96□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 CMC4YMR194C-B 222 nt0.96□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 MCM10YIL150C 1716 nt0.95□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.94□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 snR36snR36 182 nt0.94□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 YDR344CYDR344C 444 nt0.93□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.93□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 NHP2YDL208W 471 nt0.92□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 YFL063WYFL063W 456 nt0.92□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 YGL149WYGL149W 306 nt0.92□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 RPS27BYHR021C 249 nt0.92□□□□□ -2.26
RTN2Q12443 YKL118WYKL118W 312 nt0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.2 ms